KCI등재
다초점 세포 영상으로부터 추정된 초점 값을 이용한 3차원 형태 복원
저자
최예준(Yea-Jun Choi) ; 이동우(Dong-Woo Lee) ; 김명희(Myoung-Hee Kim) ; 최수미(Soo-Mi Choi) 연구자관계분석
발행기관
학술지명
컴퓨터그래픽스학회논문지(Journal of the Korea Computer Graphics Society)
권호사항
발행연도
2017
작성언어
Korean
주제어
등재정보
KCI등재
자료형태
학술저널
수록면
31-40(10쪽)
KCI 피인용횟수
0
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제공처
최근 3차원 세포 배양이 가능해 지면서 세포의 부피, 3차원 형태 등을 보다 정확하게 확인할 수 있게 되었다. 일반적으로 세포의 3차원 단층 정보는 공초점 현미경 또는 전자 현미경과 같은 특수한 현미경을 이용하여 관찰해야 한다. 그러나 공초점 현미경은 일반 현미경에 비해 비용이 비싸며, 촬영 시간이 오래 걸린다. 따라서 일반적으로 사용되는 광학 현미경으로 세포의 3차원 형태복원을 하는 방법이 필요하다. 본 논문에서는 다초점 형광 영상을 기반으로 영상의 추정된 초점 값(focus estimator value)을 이용해 세포를 3차원으로 형태 복원하는 방법을 제안한다. 먼저 3차원으로 배양된 세포를 광학현미경으로 초점을 변경하면서 다초점 영상들을 촬영한다. 이후 영상에서 circular Hough transform을 이용하여 세포 군집의 대략적인 위치를 ROI(Region Of Interest)로 정한다. 획득한 ROI에 MSBF(Modified Sliding Band Filter)를 적용하여 ROI 내에 세포 군집의 외곽선을 추출하고, 추출된 외곽선을 기준으로 추정 초점 값을 구한다. 계산된 초점 값과 현미 경의 NA(Numerical Aperture)을 이용하여 깊이를 고려한 세포 군집의 외곽선을 추출하고 추출된 외곽선을 통해 세포들을 3차원으로 형태 복원한다. 복원 결과는 세포 영상의 in-focus가 된 부분들을 하나로 합친 영상과 비교하여 검증한다.
더보기As 3D cell culture has recently become possible, it has been able to observe a 3D shape of cell and volume. Generally, 3D information of a cell should be observed with a special microscope such as a confocal microscope or an electron microscope. However, a confocal microscope is more expensive than a conventional microscope and takes longer time to capture images. Therefore, there is a need for a method that can reconstruct the 3D shape of cells using a common microscope. In this paper, we propose a method of reconstructing 3D cells using the focus estimator value from multi-focal fluorescence images of cells. Initially, 3D cultured cells are captured with an optical microscope by changing the focus. Then the approximate position of the cells is assigned as R0I (Region Of Interest) using the circular Hough transform in the images. The MSBF (Modified Sliding Band Filter) is applied to the obtained ROI to extract the outlines of the cell clusters, and the focus estimator values are computed based on the extracted outlines. Using the computed focus estimator values and the numerical aperture (NA) of the microscope, we extract the outline of the cell cluster considering the depth and reconstruct the cells into 3D based on the extracted outline. The reconstruction results are examined by comparing with the combined in-focus portions of the cell images.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2022 | 평가예정 | 재인증평가 신청대상 (재인증) | |
2019-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (계속평가) | KCI등재 |
2016-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (계속평가) | KCI등재 |
2012-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2010-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 FAIL (등재후보1차) | KCI후보 |
2008-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.07 | 0.07 | 0.05 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.05 | 0.04 | 0.297 | 0 |
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