SCOPUS
SCIE
Mammalian Systems Biotechnology Reveals Global Cellular Adaptations in a Recombinant CHO Cell Line
저자
Yusufi, F.N.K. ; Lakshmanan, M. ; Ho, Y.S. ; Loo, B.L.W. ; Ariyaratne, P. ; Yang, Y. ; Ng, S.K. ; Tan, T.R.M. ; Yeo, H.C. ; Lim, H.L. ; Ng, S.W. ; Hiu, A.P. ; Chow, C.P. ; Wan, C. ; Chen, S. ; Teo, G. ; Song, G. ; Chin, J.X. ; Ruan, X. ; Sung, K.W.K. ; Hu, W.S. ; Yap, M.G.S. ; Bardor, M. ; Nagarajan, N. ; Lee, D.Y.
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2017
작성언어
-주제어
등재정보
SCOPUS,SCIE
자료형태
학술저널
수록면
530-5426(4897쪽)
제공처
Effective development of host cells for therapeutic protein production is hampered by the poor characterization of cellular transfection. Here, we employed a multi-omics-based systems biotechnology approach to elucidate the genotypic and phenotypic differences between a wild-type and recombinant antibody-producing Chinese hamster ovary (CHO) cell line. At the genomic level, we observed extensive rearrangements in specific targeted loci linked to transgene integration sites. Transcriptional re-wiring of DNA damage repair and cellular metabolism in the antibody producer, via changes in gene copy numbers, was also detected. Subsequent integration of transcriptomic data with a genome-scale metabolic model showed a substantial increase in energy metabolism in the antibody producer. Metabolomics, lipidomics, and glycomics analyses revealed an elevation in long-chain lipid species, potentially associated with protein transport and secretion requirements, and a surprising stability of N-glycosylation profiles between both cell lines. Overall, the proposed knowledge-based systems biotechnology framework can further accelerate mammalian cell-line engineering in a targeted manner.
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