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한국인 윌슨병 유전자의 일배체형 분석과 R778L 돌연변이에서 창시자효과에 대한 연구 = Original Articles : Haplotype analysis and possible founder effect at the R778L mutation of the ATP7B gene in Korean patients with Wilson`s disease
저자
배선환 ( Sun Hwan Bae ) ; 김종원 ( Jong Won Kim ) ; 서정기 ( Jeong Kee Seo )
발행기관
학술지명
Clinical and Molecular Hepatology(대한간학회지)(Clinical and Molecular Hepatology)
권호사항
발행연도
2009
작성언어
-주제어
KDC
510
등재정보
KCI등재,SCOPUS,SCIE
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
309-319(11쪽)
KCI 피인용횟수
1
제공처
배경/목적: 윌슨병은 ATP7B 유전자의 돌연변이에 의하여 구리대사에 이상이 발생하는 상염색체열성 질환이다. 윌슨병 유전자의 돌연변이가 300여종이 넘고, 인종별, 지역별 차이가 뚜렷하여, 한국인 윌슨병 유전자 연구는 중요성을 갖는다. 본 연구는 한국인 윌슨병 환자에서 빈발하는 돌연변이를 확인하고, 처음으로 한국인 윌슨병 유전자의 일배체형(haplotype)을 분석하며, 나아가 한국인 윌슨병 유전자에 창시자효과(founder effect)가 존재하는지를 확인하고자 시행되었다. 대상과 방법: 21명의 윌슨병 환아와 환아의 부모 42명, 총 63명을 대상으로 혈액을 채취하여 중합효소연쇄반응(PCR, polymerase chain reaction)을 시행한 후, 직접 염기서열분석방법(direct sequencing method)을 사용하여 돌연변이를 분석하였으며, 발광체가 붙여진 시발체를 사용하여 D13S315, D13S1325 및 D13S316 초위성체(microsatellies)에 대한 분석을 시행하였다. 윌슨병 유전자에 존재하는 창시자효과를 확인하기 위하여, 부모의 정상 DNA 42개를 대조군으로 이용하였다. 연쇄비평형(linkage disequilibrium)을 확인하기 위한 통계적 분석은 Chi-square검사를 이용하였으며, 일배체형 사이의 빈도를 비교한 통계적 분석은 Fisher`s Exact검사를 이용하였고, P 값이 0.05 미만일 때 통계적으로 유의하다고 정의하였다. 결과: 21명의 윌슨병 환아에서 모두 23개의 돌연변이가 발견되었으며, 8번 exon에 존재하는 R778L 돌연변이가 15개(65.2%), 11번 exon에 존재하는 A874V 돌연변이가 6개(26.1%), 18번 exon에 존재하는 N1270S 돌연변이가 2개(8.7%)의 DNA에서 발견되었다. R778L 돌연변이군을 대상으로 초위성체를 분석하였을 때, D13S315좌의 5번 대립유전자의 빈도가 대조군에 비해 통계적으로 유의한 차이를 보여(10/15 대 11/41, P=0.0157) 연쇄비평형을 나타내었으며, D13-S316좌의 4번 대립유전자 또한 대조군에 비해 유의한 차이를 보여(12/15 대 7/42, P=0.0001) 연쇄비평형을 나타내었다. 돌연변이 분석과 초위성체 분석결과를 바탕으로 한국인 윌슨병 유전자의 일배체형을 구성한 결과, 가장 빈발하는 일배체형은 5-3-R778L-4(D13S315-D13S1325-돌연변이-D13S316)로, 대조군과 비교하여 통계적으로 유의한 빈도차를 보였다(P=0.0213). 통계적 의미가 없는 것으로 나타난 D13S1325를 배제하고 구성한 5-R778L-4(D13S315-Mutation-D13S316) 일배체형의 빈도는 대조군과 비교하여 더욱 유의한 차이를 나타내었다(P=0.0018). 결론: D13S315-R778L-13S316(5-돌연변이-4) 일배체형이 한국인 윌슨병 유전자의 원시 일배체형(arche haplotype)으로 추정되며, 한국인 윌슨병은 R778L 돌연변이에 창시자효과가 존재하는 것으로 생각된다.
더보기Background/Aims: Wilson`s disease (WD) is an inherited disorder of copper metabolism caused by alteration of the P-type adenosine triphosphatase (ATP) 7B gene. In this study, we analyzed the frequency of well-known mutations and constructed the first haplotypes for Koreans. In addition, we evaluated whether a founder effect existed in Korean patients with WD. Methods: We obtained DNA samples from 21 patients with WD and their parents (total cohort n=63). ATP7B gene mutations were identified by direct sequencing methods, and microsatellite typing was performed at D13S315, D13S1325, and D13S316 with fluorescent dye-labeled primers. Any founder effect was identified by using 42 normal alleles from parents with a normal phenotype as a control group. The x2 test and Fisher`s exact test were used for statistical analysis. Results: Three common mutations were found in 23 chromosomes obtained from 21 patients: the R778L mutation at exon 8 (15/23, 65.2%), the A874V mutation at exon 11 (6/23, 26.1%), and the N1270S mutation at exon 18 (2/23, 8.7%). D13S315 and D13S316 showed linkage disequilibrium at alleles 5 and 4, respectively, in patients with the R778L mutation (P=0.0157 and 0.0001, respectively). The haplotype made up of these two alleles occurred significantly more frequently in patients with the R778L mutation (5-R778L-4, D13S315-mutation-D13S316) than in the controls (P=0.0018). Conclusions: The arche haplotype of the ATP7B gene in Korean patients with WD may be 5-R778L-4 (D13S315-mutation-D13S316), and it might illustrate a founder effect. (Korean J Hepatol 2009,15:309-319)
더보기분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2012-06-18 | 학술지명변경 | 한글명 : The Korean Journal of Hepatology -> Clinical and Molecular Hepatology외국어명 : The Korean Journal of Hepatology -> Clinical and Molecular Hepatology | KCI등재 |
2011-01-18 | 학술지명변경 | 한글명 : 대한간학회지 -> The Korean Journal of Hepatology | KCI등재 |
2010-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2006-04-10 | 학회명변경 | 영문명 : The Korean Association For The Study Of The Liver -> The korean Association for the Study of the Liver | KCI후보 |
2006-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2005-06-27 | 학술지명변경 | 외국어명 : The Korean Association for The Study of The Liver -> The Korean Journal of Hepatology | KCI후보 |
2004-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.11 | 0.11 | 0.16 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.16 | 0.15 | 0.442 | 0.03 |
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