Ribotyping을 이용한 장구균의 균종 동정 = Species Indentification of Enterococcus by Ribotyping
목 적 : 장구균은 주요 병원 감염균의 한 가지로서 E. faecalis가 가장 흔한 감염균이나, 최근에는 E. faecium, E. raffinosus, E. gallinarum 등에 의한 감염이 증가되고 있다. 또한, 균종별 항생제 내성 양상이 달라 정확한 균종 동종이 요구되고 있다. 본 연구에서는 Vitek Gram-Positive Identification card 로 균종 동정이 안 된 균주들을 재동정하고자 rebotyping과 Facklam과 Sahm 의 scheme에 따른 관례적 방법으로 장구균의 균종 동정을 시도하였다.
방 법 : 12종의 American Type Culture Collection 균주와 임상 검체에서 분리되어 Vitek Grampositive Identification card로 장구균속으로 동정된 73균주 (E. faecalis 8주, E. fiecium 8주, E. avium 13주, E. durans 5주, 균종 동정이 안된 39주)를 대상으로 rebotyping을 시행하고 Facklam과 Sahm의 Scheme에 따른 생화학적, 물리적 성상을 관찰하였다.
결 과 : ribotyping으로 모든 균주의 균종 감별을 할수 있었으며, E. faecium은 두 종류의 ribotype을 나타내었다. Vitek GPI card로 동정되지 않았던 39균주 중 25균주는 E.faecium으로, 5균주는 E. gallinarum, 5균주는 E. cassliflavus, 3균주는 E.avium, 1균주는 E. hirae로 동정되었다.
결 론 : Bcl I Hind Ⅲ로 처리후 ribotyping 한 결과 12종의 표준 균주와 임상 검체에서 분리된 73균주를 모두 균종 감별할 수 있었으며, 장구균의 균종 동정에 우수한 방법으로 생각되었다.
Background: Emerging drug resistance and increasing incidence of enterococci infection necessitates an accurate identification.
Method: We compared the identification of twelve strains of American Type Culture Collection(ATCC)(E. faecalis, E. avium, E. feacium, E. raffinosus, E durans, E. casseliflavus, E. hirae, E. flavescens, E. maladoratus, E. mundtii, and E. sulfureus) and 73 clinical isolates of enterococci(E. faecalis 8, E faecium 8, E. avium 13, E. durans 5, and unidentified strains 39) by Vitek Gram-positive identification card(version R08.1, bio- Merieux Vitek, Hazelwood. Mo., U.S.A.), ribotyping and conventional scheme of Facklam and Sahm.
Resuits: All ATCC strains could be identified on the basis of characteristic 16S-23S rDNA fingerprint patterns by using Bcl I and Hind Ⅲ. Of 39 strains unidentified by Vitek GPI card, 25 strains were identified as E. faecium, 5 strains were E. gallinarum, 5 strains were E. casseliflavus, 3 strains were E. avium and 1 strain was E. hirae.
Conclusion: By ribotyping with Bcl I and Hind Ⅲ digestion, all twelve ATCC strains and 73 clinical strains were identified and it seems to reliable method for identification of Enterococcus species.
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