Shigella flexneri ATCC 29903를 이용한 ERIC-과 REP-PCR 반응 구성성분 농도의 최적화 = Optimization of the concentrations of ERIC-and REP-PCR components to identify Shigella flexneri ATCC 29903
저자
발행기관
중앙대학교 유전공학연구소(Institute of Genetic Engineering Chung-Ang University)
학술지명
권호사항
발행연도
2001
작성언어
Korean
주제어
KDC
574.000
자료형태
학술저널
수록면
1-11(11쪽)
제공처
We attempted to optimize the concentrations of PCR components such as MgCl2, Primers, dNTPs and template DNA to produce fingerpriting patterns of the ERIC- and REP-PCR products for Shigella flexneri ATCC 29903, The ERIC-PCR reactions resulted in a total number of 6 to 9 fragments and the REP-PCR reactions a total number of 10 to 14 fragments. These Phenomena can be explained by the hypothesis that more copies of REP sequences are present on bacterial chromosomes than those of ERIC sequences are. ERIC-PCR reactions generated two major bands of 0.7kb and 1.2kb DNA fragments. They also had the number of PCR products and their band intensity increased as the concentrations of the above four PCR components were increased REP-PCR reactions generated multiple PCR Products between 0.6kb and 4.1kb in size including three major bands of 0.6kb, 0.7kb and 2.2kb DNA fragments. Their band intensity was also increased as the concentrations of the above four PCR components were increased. The PCR reaction cocktails containing 2.0mM MgCl2, 2.0μM primers, 200μM dNTPs and 1.0㎕ template DNA, respectively, yielded the maximum number of PCR products. As the above four components were added more than the concentrations mentioned above in PCR reaction cocktails, the number of PCR products was not increased and the overall fingerprinting patterns remained unchanged. Therefore, a PCR reaction cocktail containing 2.0mM MgCl2, 2.0μM primers, 200μM dNTPs and 1.0㎕ template DNA can be suggested to generate the most optimized PCR fingerprinting patterns .
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