유전자 보존 정보 기반 이분 그래프의 네트워크 전파 알고리즘을 이용한 microRNA 기능 예측 방법 = microRNA functional study by network propagation algorithm of bipartite graph based on gene conservation information
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학술지명
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발행연도
2009
작성언어
Korean
KDC
004
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
259-262(4쪽)
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microRNA는 생체 내에서 유전자 발현을 조절하는 기능을 수행하는 중요한 분자이다. 하지만 각각의 microRNA들의 실질적인 기능에 대해서는 아직 명확히 밝혀지지 않은 상황이다. 생명체의 각 분자들은 진화적으로 각 종간에 서로 보존되어 왔으며, microRNA와 유전자들 역시 보존되어 있다. 본 논문에서는 각 종 간에 유사한 microRNA들은 조절할 수 있는 유전자들과의 관계 및 그 기능 역시 서로 보존되어 있을 것이라는 가정 하에서, 각 microRNA들의 기능을 예측해 보았다. microRNA와 유전자 간의 조절 관계를 이분 그래프로 표현한 후, 서열 유사도 및 유전자 보존 정도에 기반한 각 노드의 값을 네트워크 전파 알고리즘을 통해 학습한다. 이 과정을 통해 기능을 알기 원하는 특정 microRNA와 보존 정도가 높은 유사한 microRNA를 다른 종에서 찾아낼 수 있다. 본 논문에서는 이와 같은 학습 방법을 통해 microRNA의 기능을 예측하는 것이 가능함을 확인한다.
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