다이옥신으로 유발된 생쥐의 조혈모세포 증식장애에서 Oligonucleotide-Microarray를 이용한 유전자표식자의 발굴 = Marker-Genes for Dioxin-Induced Hematopoietic Stem Cell Dysfunction using the Oligonucleotide-Microarray in Mice
To develop the biomarkers for the immune dysfunction induced by dioxin, 2, 3, 7, 8-TCDD was administered C57BL/6N mice 0.1㎍ TCDD/㎏ body weight. Colony forming assay showed that the proliferation potential of hemotopoieti progenitor cells in bone marrow was reduced 35-55% more by earlier exposure. The microarray experiments were duplicated, and the candidates were restricted for the genes expressed greater than 121-fold. Resulting candidates were 55 genes. The expression patterns of the whole genes were analyzed by self-organizing maps (SOM). From these results, we selected the stage-specific genes : one genes (SOM c21 : nadh dehydrogenase subunit 5 gene) for gestational 13.5day, 13 genes (c0 : sialophorin ; spn gene, etc) for postnatal 3 week. The above genes are proposed to be a potential use of biomarker for dioxin exposure in the case of immume dysfunctions.
더보기내분비교란물질로 가장 잘 알려진 다이옥신에 의한 면역장애는 면역기관이 성숙된 후에 나타나므로 다이옥신의 노출에 의한 것인지 인과관계의 평가가 매우 어렵다. Dioxin ( 2, 3, 7, 8-TCDD)에 의한 면역기능의 저하 및 그 재표 유전자를 발굴하기 위해, C57BL/6 생쥐에서 임신 및 발생 성장 시기별로 dioxin을 노출하였다. 면역지표로서 골수 혈액줄기세포의 집락 형성이 현저하게(35~55%) 감소하였다. 말초혈액에서 유전자 발현의 변화를 생쥐용 고밀도(11K) oligonucleotide microarray로 측정하였고, 각 시기별로 대변이 가능한 유전자는 Selforganization maps (SOM) clustering으로 분석하였다. Biomarker로서 유용성을 위해 2회 반복하여 공통된 유전자를 선택하였고, 이 중 유전자 발현의 변동 폭이 2 이상 되는 유전자를 선택한 결과 55개를 고를 수 있었다. 시기별 대변이 가능한 SOM과 그 결과가 서로 일치하는 유전자는 임신 1305일에서 SOM c21인 1개(nadh dehydrogenase subunit 5), 생후 3주에서 c0 유전자 10개와 c16 유전자 3개(c0 : sialophorin ; spn 외 9개, c16 : ribosomal protein 113a ; rp113a 외 2개)를 발굴할 수 있었다. 다이옥신에 의한 면역 장애 및 노출 영향을 평가하는 biomarker로 사용할 수 있음을 알았다.
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