유전자 발현 패턴을 이용한 RNAi 기반 피드백 루프 예측 = Prediction of RNAi-based Feedbacks Loop using Gene Expression Patterns
저자
양경애(Kyung-Ae Yang) ; 이제근(Je-Keun Rhee) ; 정제균(Je-Gun Joung) ; 장병탁(Byoung-Tak Zhang)
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2009
작성언어
Korean
KDC
004
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
263-267(5쪽)
제공처
소장기관
MicroRNA (miRNA)는 전사 후 (post-transcription) 단계에서 유전자 발현 조절에 관여하는 인자의 하나로, 생물의 전(全)발달과정과 환경변화에 대응하는 유전자 발현조절과정에서 중요한 역할을 한다. 본 연구에서는 다양한 환경 스트레스 조건에 노출되었을 때 얻을 수 있는 애기장대의 전사조절 인자(transcription factor, TF)들의 발현 변화 관측 데이터와 microRNA (miRNA)의 mature 형태의 염기서열 및 전사조절 부위의 서열 정보를 이용하여, 환경 스트레스 조건에 대응을 하기 위한 유전자 조절과정에서 형성할 수 있는 miRNA와 TF 간에 형성되는 피드백 루프 (feedback loop)들을 예측 하였다. 결과로 얻은 4 쌍의 루프 (NAC:miR164, ARF:miR167, CCAAT-HAP2:miR169, SCL:miR171)는 기존 문헌을 통해 이들이 환경 스트레스에 관여할 개연성이 상당히 높음을 확인할 수 있었다. 이런 결과로부터 제시한 접근 방법이 효과적임을 알 수 있었고, 생물 종을 확대하여 적용할 수 있을 것으로 기대한다.
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