KCI우수등재
AFLP Marker를 이용한 한국 재래돼지의 유전적 다양성 및 품종식별 = Genetic Diversity and Breed Identification of Korean Native Pig Using AFLP Markers
본 연구는 한국재래돼지의 순수 혈통정립 및 유전자원 보존을 목적으로 AFLP 다형성을 분석하고 이를 유전적 표지인자로 이용하여 재래돼지의 유전적 특성을 분자 수준에서 규명하고 품종 집단내 유전적 변이성과 품종 특이적인 DNA marker를 탐색하며 동시에 타품종들과의 유전적 근연관계를 추정하기 위해 수행하였다. 13종류의 selective primer 조합형을 이용하여 분석한 결과 총 band의 수는 611개로 각 조합형 당 평균 47개의 band가 확인되었으며 이 가운데 다형적 band가 152개로 다형성 수준은 약24.5%였다. 한국 재래돼지의 다형율과 유전적 다양성 값은 각각 29.8%와 2.9로 개량종에 비해서 다소 높은 경향이었다. 한편, 13종류의 primer 조합형 가운데 E35/T38 및 E38/H13 primer 조합형에서 품종간의 차이를 나타내는 DNA marker가 확인되었다. 특히, 재래돼지에서 검출된 E35/T38 primer 조합형의 0.50kb, 0.25kb 및 0.38kb의 DNA band는 개량종과 명확히 구별되어 이들 품종 특이적 DNA band는 한국 재래돼지의 품종식별에 유용한 표지인자로 이용 가능할 것으로 기대된다. 품종간 유전적 근연관계에서 한국 재래돼지는 Hampshire종과 유전적 유사성이 가장 높은 것으로 추정되었다. 본 연구에서 검출한 한국 재래돼지의 AFLP 유전자 지문은 재래돼지 집단의 유전적 변이성 및 타 품종과의 근연관계 분석뿐만 아니라 경제형질과 연관된 marker 개발에 유용한 DNA 표지인자로 활용할 수 있을 것으로 기대된다.
For the purpose of genetic conversation and utilization of Korean native pig(KNP) as a valuable animal genetic resource, DNA polymorphisms of AFLP (amplified fragment length polymorphisms) as genetic markers were analyzed in KNP and foreign pig breeds (Landrace, Duroc, Hamphsire and Yorkshire). Using these AFLP markers, the genetic structure and characteristics of KNP population were analyzed at the DNA level and the genetic variability and diversity within and between breed population were evaluated. Breed-specific DNA marker for KNP was screened, and phylogenetic relationship within and among breeds were estimated. A total of 611 AFLP markers were amplified by 13 selective primer combinations, and the average number of bands per primer combination was 47.0. Among them 152 bands were polymorphic (24.5%). The rate of polymorphisms and genetic diversity values of KNP (29.8% and 2.90) was higher than these of other foregin breeds. E35/T38 and E38/H13 primer combinations produced AFLP banding patterns which clearly discriminated between KNP and other foreign pig breeds. Three bands(0.50kb, 0.25kb and 0.20kb) identified in E35/T38 and two bands(0.45kb and 0.38kb) identified in E38/H13 primer combinations were present in all of the KNP examined, but not present in the foreign pig breeds. Therefore, these two primer combinations could be used as breed-specific DNA markers for breed identification of KNP. In comparison of genetic distances among pig breeds, KNP was the most closely related to the Hampshire breed. AFLP fingerprints may be useful for genetic variability and relationships and development of breed-specific DNA markers in pig breeds.
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