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Genetic diversity and population structure of the amylolytic yeast Saccharomycopsis fibuligera associated with Baijiu fermentation in China
저자
Wang Ju-Wei (Chinese Academy of Sciences) ; Han Pei-Jie (Chinese Academy of Sciences) ; Han Da-Yong (Chinese Academy of Sciences) ; Zhou Sen (Shunxin Agriculture Co. Ltd.) ; Li Kuan (Chinese Academy of Sciences) ; He Peng-Yu (Chinese Academy of Sciences) ; Zhen Pan (ShanxiFenjiu Co. Ltd.) ; Yu Hui-Xin (ShanxiFenjiu Co. Ltd.) ; Liang Zhen-Rong (Tianlongquan Distillery Co. Ltd.) ; Wang Xue-Wei (Chinese Academy of Sciences) ; Bai Feng-Yan (Chinese Academy of Sciences)
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2021
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English
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KCI등재,SCIE,SCOPUS
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학술저널
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753-762(10쪽)
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The amylolytic yeast Saccharomycopsis fibuligera is a predominant species in starters and the early fermentation stage of Chinese liquor (Baijiu). However, the genetic diversity of the species remains largely unknown. Here we sequenced the genomes of 97 S. fibuligera strains from different Chinese Baijiu companies. The genetic diversity and population structure of the strains were analyzed based on 1,133 orthologous genes and the whole genome single nucleotide polymorphisms (SNPs). Four main lineages were recognized. One lineage contains 60 Chinese strains which are exclusively homozygous with relatively small genome sizes (18.55–18.72 Mb) and low sequence diversity. The strains clustered in the other three lineages are heterozygous with larger genomes (21.85–23.72 Mb) and higher sequence diversity. The genomes of the homozygous strains showed nearly 100% coverage with the genome of the reference strain KPH12 and the sub-genome A of the hybrid strain KJJ81 at the above 98% sequence identity level. The genomes of the heterozygous strains showed nearly 80% coverage with both the sub-genome A and the whole genome of KJJ81, suggesting that the Chinese heterozygous strains are also hybrids with nearly 20% genomes from an unidentified source. Eighty-three genes were found to show significant copy number variation between different lineages. However, remarkable lineage specific variations in glucoamylase and α-amylase activities and growth profiles in different carbon sources and under different environmental conditions were not observed, though strains exhibiting relatively high glucoamylase activity were mainly found from the homozygous lineage.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2013-12-02 | 학술지명변경 | 외국어명 : The Journal of Microbiology -> Journal of Microbiology | KCI등재 |
2010-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2006-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2001-07-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
1999-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 1.76 | 0.2 | 1.22 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.91 | 0.73 | 0.399 | 0.07 |
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