KCI등재
SCOPUS
High-Resolution Bin Maps Provide Insights for QTL Mapping of Yield-Related Traits with Milyang23/Gihobyeo Recombinant Inbred Lines
저자
이예지 (National Institute of Agricultural Sciences, RDA, Korea) ; Nam-In Hyung (Sangmyung University) ; 김태호 (National Institute of Agricultural Sciences, RDA, Korea)
발행기관
학술지명
Plant Breeding and Biotechnology(Plant Breeding and Biotechnology)
권호사항
발행연도
2020
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재,SCOPUS
자료형태
학술저널
수록면
293-306(14쪽)
KCI 피인용횟수
0
제공처
High-throughput genotyping has substantially advanced the quality and accuracy of single nucleotide polymorphism (SNP) discovery and provided an effective way to interpret phenotypic variations in a mapping population. High-resolution quantitative trait locus (QTL) mapping is important for understanding agricultural traits. However, constructing a high-resolution map without sufficient markers to detect QTLs/genes of agronomically important traits is laborious and time consuming. In this study, 160 recombinant inbred lines (RILs) derived from a cross between Milyang23 and Gihobyeo were re-sequenced, and their SNPs were used for high-resolution QTL mapping of yield-related traits. A total of 1,850,671 high-quality SNPs from RILs were detected, and 3,563 bins were used as genetic markers to construct a high-resolution genetic map using the sliding window approach. The total genetic distance was 1,278.62 cM. Using the QTL analysis, we identified 35 QTLs controlling six yield traits, namely, culm length, panicle length, panicle number per plant, primary branch number per panicle, grain number per plant, and 100-grain weight. In addition, we detected major QTLs associated with culm length and grain number, and compared their physical distances using a conventional genetic map.
These results showed that rapid, high-resolution QTL mapping using high-quality SNPs as bin markers is a powerful tool for finemapping and cloning important QTLs/genes.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2015-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (계속평가) | KCI등재 |
2013-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.44 | 0.44 | 0.35 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0 | 0 | 0.667 | 0.13 |
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