바이오데이터의 효율적인 저장과 공유를 위한 시스템 설계 = System Design for Efficient Storage and Sharing Biodata
저자
발행사항
서울 : 세종대학교 일반대학원, 2010
학위논문사항
학위논문(석사)-- 세종대학교 일반대학원 대학원 : 컴퓨터공학과 2010. 2
발행연도
2010
작성언어
한국어
주제어
DDC
004.21 판사항(22)
발행국(도시)
서울
기타서명
System Design for Efficient Storage and Sharing Biodata
형태사항
61 p. : 삽도 ; 26cm
일반주기명
세종대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.
지도교수:신동규
참고문헌: p.52-56
소장기관
Microarray experiment creates huge data as typical genetic manifestation. However, the whole data isn't analyzed and researched in experiment and partial data is used. Therefore, smooth sharing and efficeient management can reduce cost and time on experiment.
This paper describes sysemt which stores and manages MAGE-ML, standard format of microarray, on RDBMS. For efficient storage and management, the system applies Inlining technique on MAGE-ML schema and simplifies Objec-Relation mapping as creating relational schema by classifying elements using strrucrural similarity. And it makes sharing smooth as the RDBMSs connect on Grid.
생명정보학 분야의 대표적인 유전자 발현 분석 기법인 마이크로어레이 실험은 엄청난 양의 데이터를 생성한다. 하지만 실제로 유전자 관련 실험에서는 그 데이터를 전부 분석하고 연구하는 것이 아니라 한정된 부분만을 사용하거나 무시하는 것이 대부분이다. 따라서 마이크로어레이 데이터를 원활히 공유하고 저장관리할 수 있다면 실험에 드는 비용과 시간을 줄일 수 있다.
본 논문에서는 RDBMS를 이용하여 마이크로어레이 데이터의 표준 형식인 MAGE-ML를 저장, 관리하고 그 RDBMS를 그리드 기법을 이용하여 공유하는 시스템을 설계하는 것을 보인다. RDBMS로의 저장을 효율적으로 하기위하여 MAGE-ML의 스키마에 인라인 기법을 적용하여 스키마를 단순화 하고 그 스키마를 구조적 유사성에 기반한 엘리먼트 분류 기법을 이용하여 관계형 스키마를 생성함으로써 객체-관계 맵핑을 단순화 한다. 그리고 그 RDBMS를 그리드를 이용하여 공유함으로써 원활한 공유가 이루어지도록 하였다.
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