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SNPs and Haplotypes of Ets variant 6 (ETV6) Gene Is Associated with Overweight/Obese in Korean Population
저자
Kyung Hee Jung ; Sung Wook Kang ; Su Kang Kim ; Jeong Yoon Song ; Hyung Kyung Park ; Hyung Hwan Baik
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2009
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재
자료형태
학술저널
수록면
163-168(6쪽)
제공처
Ets variant 6 (ETV6) 유전자는 염색체의 재배열과 관련이 있는 백혈병에 관련이 되었다고 알려져 있다. 이번 연구에서, 과체중이 백혈병과 과체중/비만에 위험 요소로 작용을 조사하였다. 55개의 single nucleotide polymorphisms (SNPs)을 Affymetrix Genotyping chip array 방식을 이용 분석하였는데, 분석에는 206명의 과체중/비만과 152명의 한국 정상인이 참여되었다. 그리고 통계분석으로는 logistic and multiple regression 방법이 사용되었다. 55개의 polymorphism 중, 4개 (rs2723825, rs17818048, rs2710304 그리고 rs7296981)에서 유의성이 관찰되었다. 그리고 2개의 하플로 타입 중에 블록 7(GGG)과 9(CCC)에서 유의성이 있는 확인할 수 있었다. 유의성을 보였던 블록에는 유의성이 있던 polymorphism이 포함되어 있었다. 우리의 실험 결과에서, ETV6는 한국인의 과체중/비만에 관계가 있다는 것을 밝혀졌다.
Ets variant 6 (ETV6) gene is known to be involved in a large number of chromosomal rearrangements associated with leukemia. In recent study, it is reported that excess body weight may be a risk factor for leukemia and overweight/obesity have greater risk of leukemia compared to non-overweight individuals. For a possible relation of the genetic polymorphism of ETV6 with overweight/obesity, we genotyped fifty-five single nucleotide polymorphisms (SNPs) of ETV6 using the Affymetrix Genotyping chip array in 206 overweight/obese and 152 normal subjects in the Korean population. Logistic and multiple regression models were employed to analyze the genetic contributions of polymorphisms. Of the fifty five polymorphisms, the four SNPs showed a significant association with overweight/obesity in 3 alternative models (codominant, dominant, and recessive models; p<0.05 after adjusting for age and sex) were rs2723825, rs17818048, rs2710304, and rs7296981. Two haplotypes of ETV6 (block 7: GGG; block 9: CCC) containing significant polymorphisms (rs17818048, rs2710304, and rs7296981) exhibited significant association with the risk of overweight/obesity. Our results suggest that polymorphisms in ETV6 may be associated with overweight/obese in Korean population. (Korean J Str Res 2009;17:163∼168)
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