박테리아 coding, non coding DNA서열의 부호 엔트로피 분석 = Symbolic entropy analysis of coding and non coding DNA sequences in bacteria
저자
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2004
작성언어
Korean
KDC
051.000
자료형태
학술저널
수록면
395-404(10쪽)
제공처
본 연구는 박테리아 DNA서열의 부호화 정보 엔트로피 측정으로 생물적 기능을 정보량으로 정량화 시킬 수 있음을 제시한다. DNA서열은 네 개의 염기 아데닌, 구아닌, 시토신, 티아민으로 구성되어 있다. DNA 서열을 부호 서열로 구성하기 위해 염기를 두 가지 방법으로 분류했다. 첫 번째로 염기를 그들의 화학적 구조에 따라 purine "quot;={A,G}와 pyrimidine "quot;={C,T}으로 분류하였다. 두 번째는 화학적 구조와 수소결합의 강도를 모두 고려하여 분류하였다. 우선 수소 결합을 살펴보면 약한 수소 결합을 가지는 "quot;={A,T}와 강한 수소결합을 가지는 "quot;={G,C}로 분류하였다. 화학적 결합과 수소 결합을 모두 고려하면A=[1 1]=3 , G=[1 0]=2, T=[0 1]=1, C=[0 0]=0 으로 4개의 심볼 값을 가지게 된다. 이렇게 구성된 심볼 서열로 세 개의 부호를 하나의 워드로 사용하여 단백질 코딩 서열과 논 코딩 서열의 엔트로피를 계산하였다. 박테리아의 게놈 서열은 모두 무작위적으로 보이지만 단백질 코딩 서열과 논 코딩 서열이 서로 다른 엔트로피 값을 가지고 통계적으로 유의함을 확인했다
The purpose of this study was that an entropy might play a role in revealing information contents of biological functioning in DNA sequences. A DNA sequences can be identified with a word over the four nucleic acid bases: adenine, guanine, cytosine, thymine. DNA sequences are converted into two type of symbolic sequences according to their chemical and biological characteristics, In primary classification, the four bases A, C, G, T can be divided into two classes according to the chemical structures, i.e., purine "1"={A,G} and pyrimidine "0"={C,T}. Further classification can be also made according to the strength of the hydrogen bond, i.e., weak H bonds "1"={A,T} and strong H bonds "0"={G,C}. Combination of chemical structure and H bond strength leads to symbol value for four nucleic acid bases; A=[1 1]="3", G=[1 0]="2", T=[0 1]="1", C=[0 0]="0". We calculated the corrected information entropy and entropy rate of a distribution of words with three symbols in the coding and non coding sequences. Although all the CDS sequences in bacteria look like random sequences, we find that coding sequences and non coding sequences have different entropy values with statistical significance
서지정보 내보내기(Export)
닫기소장기관 정보
닫기권호소장정보
닫기오류접수
닫기오류 접수 확인
닫기음성서비스 신청
닫기음성서비스 신청 확인
닫기이용약관
닫기학술연구정보서비스 이용약관 (2017년 1월 1일 ~ 현재 적용)
학술연구정보서비스(이하 RISS)는 정보주체의 자유와 권리 보호를 위해 「개인정보 보호법」 및 관계 법령이 정한 바를 준수하여, 적법하게 개인정보를 처리하고 안전하게 관리하고 있습니다. 이에 「개인정보 보호법」 제30조에 따라 정보주체에게 개인정보 처리에 관한 절차 및 기준을 안내하고, 이와 관련한 고충을 신속하고 원활하게 처리할 수 있도록 하기 위하여 다음과 같이 개인정보 처리방침을 수립·공개합니다.
주요 개인정보 처리 표시(라벨링)
목 차
3년
또는 회원탈퇴시까지5년
(「전자상거래 등에서의 소비자보호에 관한3년
(「전자상거래 등에서의 소비자보호에 관한2년
이상(개인정보보호위원회 : 개인정보의 안전성 확보조치 기준)개인정보파일의 명칭 | 운영근거 / 처리목적 | 개인정보파일에 기록되는 개인정보의 항목 | 보유기간 | |
---|---|---|---|---|
학술연구정보서비스 이용자 가입정보 파일 | 한국교육학술정보원법 | 필수 | ID, 비밀번호, 성명, 생년월일, 신분(직업구분), 이메일, 소속분야, 웹진메일 수신동의 여부 | 3년 또는 탈퇴시 |
선택 | 소속기관명, 소속도서관명, 학과/부서명, 학번/직원번호, 휴대전화, 주소 |
구분 | 담당자 | 연락처 |
---|---|---|
KERIS 개인정보 보호책임자 | 정보보호본부 김태우 | - 이메일 : lsy@keris.or.kr - 전화번호 : 053-714-0439 - 팩스번호 : 053-714-0195 |
KERIS 개인정보 보호담당자 | 개인정보보호부 이상엽 | |
RISS 개인정보 보호책임자 | 대학학술본부 장금연 | - 이메일 : giltizen@keris.or.kr - 전화번호 : 053-714-0149 - 팩스번호 : 053-714-0194 |
RISS 개인정보 보호담당자 | 학술진흥부 길원진 |
자동로그아웃 안내
닫기인증오류 안내
닫기귀하께서는 휴면계정 전환 후 1년동안 회원정보 수집 및 이용에 대한
재동의를 하지 않으신 관계로 개인정보가 삭제되었습니다.
(참조 : RISS 이용약관 및 개인정보처리방침)
신규회원으로 가입하여 이용 부탁 드리며, 추가 문의는 고객센터로 연락 바랍니다.
- 기존 아이디 재사용 불가
휴면계정 안내
RISS는 [표준개인정보 보호지침]에 따라 2년을 주기로 개인정보 수집·이용에 관하여 (재)동의를 받고 있으며, (재)동의를 하지 않을 경우, 휴면계정으로 전환됩니다.
(※ 휴면계정은 원문이용 및 복사/대출 서비스를 이용할 수 없습니다.)
휴면계정으로 전환된 후 1년간 회원정보 수집·이용에 대한 재동의를 하지 않을 경우, RISS에서 자동탈퇴 및 개인정보가 삭제처리 됩니다.
고객센터 1599-3122
ARS번호+1번(회원가입 및 정보수정)