KCI등재후보
SCOPUS
국내 살모넬라 분리주에서 spvR 유전자 분포와 단일 뉴클레오티드 다형 연구 = Distribution and Study on Single Nucleotide Polymorphism (SNP) of spvR Gene in Korean Isolates of Salmonella
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학술지명
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발행연도
2004
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-등재정보
KCI등재후보,SCOPUS,ESCI
자료형태
학술저널
수록면
335-340(6쪽)
KCI 피인용횟수
0
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목 적 : 지금까지 병원성 살모넬라를 확인하기 위해 분자량이 큰 플라스미드의 존재 유무를 확인하여 왔으나 살모넬라 혈청형 및 검출 방법에 따라 양성율에 큰 차이를 보이고 있고, 일부 병원성 살모넬라 분리주에서 병원성 플라스미드가 관찰되지 않아 spv 유전자들의 유무에 대한 아른 확인방법이 필요하다. 본 실험은 국내 동물 유래 주요 살모넬라 혈청형에서 spvR 유전자의 분포를 알아보고, 병원성 살모넬라 분자진단을 위한 분자표지로써의 가치를 평가하기 위해 실행하였다. 재료 및 방법 : 국내 가축 유래 S. typhimurium (ST, 26주), S. enteritidis (SE, 10주), S. pullorum (SP, 40주), S. gallinarum (SG, 53주)에 대해 GenBank에 등록된 ST, SE, SP의 spvR 유전자를 비교하여 ST와 SE 간에 차이를 보이는 single nucleotide polymorphism (SNP, 625번 뉴클레오티드)을 포함하도록 시발자를 합성하여 집락- PCR을 수행하였다. 증폭 산물(194bp)은 자동 염기서열 장치를 이용하여 염기서열을 결정하였고, 제한효소인 MseI을 사용하여 PCR-RFLP를 실시하였다. 결 과 : 집락-중합효소연쇄반응 결과 SP, SG, SE의 모든 (100%) 분리주에서 특이 증폭산물이 검출되었으나 ST의 경우 19주(73%)에서만 증폭되었다. 특히 병원성 관련 플라스미드가 관찰되지 않았던 SP 4주에서 특이적인 증폭산물이 검출되었다. 염기서열 분석결과 SE, SG, SP는 625번 뉴클레오티드에 아데닌을, ST는 구아닌을 가지고 있어 PCR-RFLP를 이용하여 쉽게 구분할 수 있었다.
결 론:spvR에 대한 집락-중합효소연쇄 반응법은 병원성 플라스미드 검출법보다 SE, SP, SG 병원성 주를 신속하게 검출하는데 유용하고, 625번 뉴클레오티드의 SNP는 ST와 SE, SG, SP를 구분하는 분자표지로 사용될 수 있을 것으로 기대되며, ST에 비해 SE는 진화적으로 SG와 SP에 가까운 것으로 생각되었다.
Background:The Salmonella virulence plasmid (spv) genes (spvR, A, B, C and D) on the large virulence plasmids of pathogenic Salmonella serotypes can replace the virulence of the whole plasmid. Recently, virulence plasmid-negative pathogenic Salmonella isolates were isolated. However, positive rates of spv genes among Korean Salmonella serotypes have been obscure. spv genes are conserved in compared to other virulence genes but there are single nucleotide polymorphisms (SNPs) conserved in only certain serotype. Such SNPs are useful for differentiation and understanding evolution of certain serotypes.
Materials and Methods:Salmonella serotypes isolated from live stocks [Salmonella typhimurium (ST, 26), S. enteritidis (SE, 10), S. gallinarum (SG, 40) and S. pullorum (SP, 53)] were used for colony-PCR. A primer set covering single nucleotide polymorphism (SNP) at 625th nucleotide of spvR was designed. The nucleotide sequences of amplicons were determined by cyclic sequencing method and RFLP was performed by using MseI.
Results:All isolates of SE, SG and SP, including four plasmid-negative isolates, showed specific amplicons but not all of ST (19/26, 73%) were positive to spvR. Based on the nucleotide sequence of 625th nucleotide and PCR-RFLP, SE, SG and SP [A(625)] and ST [G(625)] could be differentiated.
Conclusion:spvR can be used as a molecular marker to detect virulent SE, SG, SP and the SNP may be useful for differentiation of SE, SG, SP and ST. According to the SNP study SE may be evolutionarily closer to SG and SP than ST.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2010-02-25 | 학술지명변경 | 한글명 : 감염과화학요법 -> Infection and Chemotherapy외국어명 : Infection and Chemotherapy -> 미등록 | KCI후보 |
2010-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2009-08-25 | 학술지명변경 | 외국어명 : 미등록 -> Infection and Chemotherapy | KCI후보 |
2008-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
2008-01-01 | 평가 | 등재후보 탈락 (등재후보1차) | |
2006-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 FAIL (등재후보2차) | KCI후보 |
2005-05-27 | 학술지등록 | 한글명 : 감염과화학요법외국어명 : 미등록 | KCI후보 |
2005-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2004-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 FAIL (등재후보1차) | KCI후보 |
2002-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.24 | 0.24 | 0.24 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.2 | 0.2 | 0.46 | 0.29 |
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