SCOPUS
SCIE
KCI등재
Microarray Analysis of Gene Expression Alteration in Human Middle Ear Epithelial Cells Induced by Asian Sand Dust
저자
Go, Yoon Young ; Park, Moo Kyun ; Kwon, Jee Young ; Seo, Young Rok ; Chae, Sung-Won ; Song, Jae-Jun
발행기관
학술지명
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발행연도
2015
작성언어
-주제어
등재정보
SCOPUS,SCIE,KCI등재
자료형태
학술저널
수록면
345-353(9쪽)
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<P><B>Objectives</B></P><P>The primary aim of this study is to evaluate the gene expression profile of Asian sand dust (ASD)-treated human middle ear epithelial cell (HMEEC) using microarray analysis.</P><P><B>Methods</B></P><P>The HMEEC was treated with ASD (400 µg/mL) and total RNA was extracted for microarray analysis. Molecular pathways among differentially expressed genes were further analyzed. For selected genes, the changes in gene expression were confirmed by real-time polymerase chain reaction.</P><P><B>Results</B></P><P>A total of 1,274 genes were differentially expressed by ASD. Among them, 1,138 genes were 2 folds up-regulated, whereas 136 genes were 2 folds down-regulated. Up-regulated genes were mainly involved in cellular processes, including apoptosis, cell differentiation, and cell proliferation. Down-regulated genes affected cellular processes, including apoptosis, cell cycle, cell differentiation, and cell proliferation. The 10 genes including <I>ADM</I>, <I>CCL5</I>, <I>EDN1</I>, <I>EGR1</I>, <I>FOS</I>, <I>GHRL</I>, <I>JUN</I>, <I>SOCS3</I>, <I>TNF</I>, and <I>TNFSF10</I> were identified as main modulators in up-regulated genes. A total of 11 genes including <I>CSF3</I>, <I>DKK1</I>, <I>FOSL1</I>, <I>FST</I>, <I>TERT</I>, <I>MMP13</I>, <I>PTHLH</I>, <I>SPRY2</I>, <I>TGFBR2</I>, <I>THBS1</I>, and <I>TIMP1</I> acted as main components of pathway associated with 2-fold down regulated genes.</P><P><B>Conclusion</B></P><P>We identified the differentially expressed genes in ASD-treated HMEEC. Our work indicates that air pollutant like ASD, may play an important role in the pathogenesis of otitis media.</P>
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