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Alginate Lyases from Alginate-Degrading <i>Vibrio splendidus</i> 12B01 Are Endolytic
저자
Badur, Ahmet H. ; Jagtap, Sujit Sadashiv ; Yalamanchili, Geethika ; Lee, Jung-Kul ; Zhao, Huimin ; Rao, Christopher V.
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2015
작성언어
-등재정보
SCI,SCIE,SCOPUS
자료형태
학술저널
수록면
1865-1873(9쪽)
제공처
소장기관
<P>Alginate lyases are enzymes that degrade alginate through β-elimination of the glycosidic bond into smaller oligomers. We investigated the alginate lyases from <I>Vibrio splendidus</I> 12B01, a marine bacterioplankton species that can grow on alginate as its sole carbon source. We identified, purified, and characterized four polysaccharide lyase family 7 alginates lyases, AlyA, AlyB, AlyD, and AlyE, from <I>V. splendidus</I> 12B01. The four lyases were found to have optimal activity between pH 7.5 and 8.5 and at 20 to 25°C, consistent with their use in a marine environment. AlyA, AlyB, AlyD, and AlyE were found to exhibit a turnover number (<I>k</I><SUB>cat</SUB>) for alginate of 0.60 ± 0.02 s<SUP>−1</SUP>, 3.7 ± 0.3 s<SUP>−1</SUP>, 4.5 ± 0.5 s<SUP>−1</SUP>, and 7.1 ± 0.2 s<SUP>−1</SUP>, respectively. The <I>K<SUB>m</SUB></I> values of AlyA, AlyB, AlyD, and AlyE toward alginate were 36 ± 7 μM, 22 ± 5 μM, 60 ± 2 μM, and 123 ± 6 μM, respectively. AlyA and AlyB were found principally to cleave the β-1,4 bonds between β-<SMALL>d</SMALL>-mannuronate and α-<SMALL>l</SMALL>-guluronate and subunits; AlyD and AlyE were found to principally cleave the α-1,4 bonds involving α-<SMALL>l</SMALL>-guluronate subunits. The four alginate lyases degrade alginate into longer chains of oligomers.</P>
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