한 남자에서 수면 박탈 시 cDNA Microarray 분석에 의한 유전자 발현 = Effects of Sleep Deprivation on Gene Expression by cDNA Microarray Analysis in One Male Subject
저자
정영철 (국립서울병원 ) ; 홍미숙 (경희대학교 의과대학 고황의학연구소 ) ; 정주호 (경희대학교 의과대학 고황의학연구소 ) ; 김종우 (경희대학교 의과대학 고황의학연구소, 늘푸른의원 )
발행기관
대한생물치료정신의학회(The Korean Society of Biological Therapies in Psychiatry)
학술지명
생물치료정신의학(Journal of the Korean Society of Biological Therapies in Psychiatry)
권호사항
발행연도
2003
작성언어
Korean
주제어
KDC
513.8
자료형태
학술저널
수록면
197-203(7쪽)
KCI 피인용횟수
0
제공처
목 적 :
본 연구에서는 약 8000개 이상의 사람의 주요 유전자를 검색할 수 있는 TwinChip Human 8K cDNA miceoarray를 이용하여, 수면 박탈이 이러한 주요 유전자의 발현 양상에 어떠한 영향을 미치는 지를 대량으로 확인하고 분석하고자 하였다.
방 법 :
Mendelson이 시행한 수면 박탈 방법을 변형하여 4일간의 일정으로 수면 박탈을 시행하였으며 첫째날(baseline) 수면 박탈 시행전과 4일째 수면 박탈 실험 완료 후에 각각 혈액채취를 하였다. 수면 박탈전과 수면 박탈후에 채취한 혈액을 대상으로 단핵세포를 분리하여 RNA를 추출후 TwinChip Human 8K cDNA microarray 반응을 시킨 후 결과를 분석하였다.
결 과 :
분석된 8287개의 유전자들 중 fluorescence ratio (Cy5/Cy3)가 3 이상인, 즉 수면 박탈 후 3배 이상 발현에 증가되었다고 볼수 있는 유전자는 NTS, RHAG, CLIPR-59, FLJ0849, Homo sapiens TFT-I interacting peptide 20mRNA, GRM3, ELK3, ETS-domain protein(SRF accessory protein 2), RBMS1 등으로 8개였고, fluorescence ratio(Cy5/Cy3)가 0.33 이하인, 즉 수면 박탈 후 3배 이상 발현이 감소되었다고 볼 수 있는 유전자는 ESTs, IL-2, ATP6V0A1, Homo sapiens cDNS FLJ31377 fis, clone NESOP100008, CYP11A, RECQL4, IGSF3, CGI-94, CALR 등으로 9개로 나타났다.
결 론 :
본 연구 결과에서 발현의 변화를 보인 유전자들을 RT-PCR이나 western blot 등의 방법을 이용하여 확인하는 후속 연구가 이루어져야 할 것이다. 향후 수면의 다양한 양상이 유전자 발현에 미치는 영향을 더 자세하게 알기 위해서는 cDNA microarray를 이용한 연구가 더욱 유용할 것으로 생각한다.
Objective : The purpose of this study was to evaluate the effect of sleep deprivation on gene expression by cDNA microarray analysis.
Methods : Subject of this study is one 27 years old male physically and psychologically healthy without sleep/wake complaints. Baseline blood sample was done at 09:00 of the day 1. Subject slept 4 hours on the day 1, 2 hours on the day 2. and total sleep, deprivation on the day 3. Blood samples was done in the morning of the day 4. Using cDNA microarray technique. gene expression profile was assayed.
Results : There were 8 qenes up-regulated and 9 genes down-regulated after sleep deprivation Up-regulated genes were NTS(neurotensin), RHAG(Rhesus blood group-associated glycoprotein), CLIPR-59(CLIP-170-related protein), FLJ0849(hypothetical protein FLJ10849). Homo sapiens TTF-l interacting peptide 20mRNA, GRM3(glutamate receptor, metabotropic 3), ELK3 ETS-domain protein(SRF accessory protein 2) RBMS1(RNA binding motif, single stranded interacting protein 1) and down-regulated genes were ESTs, IL-2(interleukin-2), ATP6V0A1 (ATPase, Htransporting, lysosomal V0 subunit a isoform), Homo sapiens cDNS FLJ31377 fis, clone NESOP100008 CYPl1A(cytochrome P450, subfamily XIA cholesterol side chain)), RECQL4(RecQ protein-like 4), IGSF3(immuno-globulin suerfamily, member 3), CGI-94(CGl-94 protein), CALR(calreticulin).
Conclusion : The results of the present study cannot fully explain the effects of sleep deprivation with respect to the expression of certain genes, but they provide fundamental data for the involvement of sleep deprivation or gene expression profiles Further in-depth studies are required to confirm the differential expression of these genes by RT-PCR or Western blot.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2026 | 평가예정 | 재인증평가 신청대상 (재인증) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (재인증) | KCI등재 |
2017-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (계속평가) | KCI등재 |
2013-01-01 | 평가 | 등재 1차 FAIL (등재유지) | KCI등재 |
2010-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2008-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 FAIL (등재후보1차) | KCI후보 |
2007-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
2005-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.62 | 0.62 | 0.87 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.7 | 0.64 | 1.34 | 0 |
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