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고-Lysine 보리 돌연변이 계통 M98 종실의 아미노산 조성 및 Proteome Profile 특성 = Characterization of Grain Amino Acid Composition and Proteome Profile of a High-lysine Barley Mutant Line M98
저자
김대욱 (국립식량과학원) ; 김홍식 (농촌진흥청 국제기술협력과) ; 박형호 (국립식량과학원) ; 황종진 (농촌진흥청 국립식량과학원) ; 김선림 (농촌진흥청 국립식량과학원) ; 이재은 (농촌진흥청 국립식량과학원) ; 정건호 (농촌진흥청 국립식량과학원) ; 황태영 (농촌진흥청 국립식량과학원) ; 김정태 (농촌진흥청 국립식량과학원) ; 김시주 (농촌진흥청 국립식량과학원) ; Randeep Rakwal (University of Tsukuba) ; 권영업 (국립식량과학원)
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학술지명
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2012
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Korean
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학술저널
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171-181(11쪽)
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Lysine is the first limiting essential amino acid in cereals for humans and monogastric animals, although its content is generally low. A chemically induced high-lysine barley mutant, M98, has an agronomically undesirable shrunken endosperm trait. In order to obtain detailed insight into the atypical traits of M98 grains, we characterized amino acid composition and protein profiles of M98 and its parent cultivar Chalssalbori.
Among a total of 16 amino acids, the percentage of each of the 7 amino acids, including lysine, was 1.2∼1.8 times higher in M98, comparing to Chalssalbori. The percentage of proline and its precursor, glutamic acid, in M98 was about the half of that of the amino acids in Chalssalbori, but arginine synthesized from glutamic acid was 1.8 times higher in M98, compared that in the parent cultivar. Theses results indicated that the mutation in M98grains might alter the proportion of amino acids linked to each other in a biosynthetic pathway. A comparison of grain proteome profiles between Chalssalbori and M98 revealed 70 differentially expressed protein spots, where 45 protein spots were up-regulated and 25 protein spots down-regulated in M98 compared to those in Chalssalbori. Of these changed protein spots, 53 were identified using nano-electrospray ionization liquid chromatography mass spectrometry. Most of these identified proteins were involved in various biological processes. In particular, 28 protein spots such as β-amylase, serpins and B3-hordein were identified as proteins associated with the atypical traits of M98. It was thought that a genetic study on the unique protein profile of M98would be needed to develop an agronomically feasible barley cultivar with high-lysine trait.
본 연구는 찰쌀보리와 M98의 종실에 함유된 아미노산 조성 및 단백질 profile의 특성 차이를 분석하여 M98의 고-Lysine 및 함몰배유 형질에 관련된 생화학적 정보를 얻고자수행하였으며, 그 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 찰쌀보리와 M98 종실의 총 16개 아미노산 조성을 분석한 결과, lysine을 비롯하여 총 6개 아미노산의 조성비가 M98에서 찰쌀보리에 비해 1.2∼1.8배 높았다.
Proline과 그것의 전구물질인 glutamic acid의 조성비는 M98에서 찰쌀보리에 비해 절반수준으로 낮았는데,glutamic acid를 전구물질로 하여 합성되는 arginine의조성비는 M98에서 찰쌀보리보다 1.8배 높았다.
2. 찰쌀보리와 M98간의 종실 단백질을 이차원전기영동으로 분리한 결과, 총 70개 단백질 spot에서 발현양상의 차이가 확인되었다. 찰쌀보리에 비해 M98에서 발현양이 높은 단백질 spot은 44개였으며, 발현양이 낮은 단백질 spot은 18개였다. 나머지 8개 단백질 spot에서 7개의 발현은 찰쌀보리에서만 확인되었고, 1개의발현은 M98에서만 확인되었다.
3. 찰쌀보리와 M98의 종실에서 발현양상 차이를 나타낸 총 53개의 단백질 spot을 선택하여 nESI-LC-MS/MS 방식으로 동정하였으며, 대부분의 단백질 spot은 종실의 다양한 생물학적 과정에 관여하는 단백질이었다. 특히, 28개 단백질 spot은 M98의 함몰배유 및 고-Lysine 형질과 연관된 단백질이었다.
4. 본 연구에서 밝혀진 M98 종실의 아미노산 조성 및단백질 발현특성 정보는 향후 M98 유래 계통을 이용한 유전학적 검토 등을 통하여 고-Lysine 형질 연관바이오마커 및 보리 신품종 개발에 유용한 정보로 활용될 수 있을 것으로 판단되었다.
분석정보
| 연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
|---|---|---|---|
| 2028 | 평가예정 | 재인증평가 신청대상 (재인증) | |
| 2022-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (재인증) | KCI등재 |
| 2019-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (계속평가) | KCI등재 |
| 2016-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (계속평가) | KCI등재 |
| 2015-12-01 | 평가 | 등재후보로 하락 (기타) | KCI후보 |
| 2011-01-01 | 평가 | 등재 1차 FAIL (등재유지) | KCI등재 |
| 2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
| 2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
| 2005-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
| 2002-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
| 1999-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
| 기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
|---|---|---|---|
| 2016 | 0.46 | 0.46 | 0.42 |
| KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
| 0.49 | 0.49 | 0.91 | 0.08 |
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