KCI등재
네트워크 모티프 분석을 통한 배추 꽃 조직 특이적 네트워크의 구성 원리 규명
저자
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학술지명
한국지능시스템학회논문지(Journal of Korean institute of intelligent systems)
권호사항
발행연도
2019
작성언어
Korean
주제어
등재정보
KCI등재
자료형태
학술저널
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36-41(6쪽)
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배추(Brassica rapa ssp. pekinensis)는 김치의 주재료로 우리의 식생활에서 빼놓을 수 없는 채소이며, 중국·일본과 함께 동양 3국에서 중요한 채소 중 하나이다. 배추의 다양한 조직을 구성하는 세포 내에 존재하는 유전자들의 조절 관계를 파악하는 것은 배추의 발달과정을 이해하는데 필수적이다. 다세포 생명체의 발달 과정 동안 개별 조직 내 세포의 상태와 외부 환경에 따라서 물리적으로 존재하는 모든 유전자와 이들 사이에 가능한 모든 상호작용 중, 일부 유전자와 그 상호작용만이 부분적, 선택적으로 활성화된다. 그러므로, 배추의 발달 과정을 이해하기 위해서는 조직별·선택적으로 활성화되는 유전자 조절 네트워크를 규명하는 연구가 필요하다. 우리는 배추의 대표적인 조직인 꽃 (flower)에 대해 부분 네트워크를 동정하고, 이것의 기능적 특징을 밝히고자 한다. 우선, 1) 조직 특이적으로 발현되는 유전자를 선별하고, 2) 알려진 유전자 조절 네트워크를 통해 선별된 유전자를 적용하여 부분 네트워크를 재구성하였다. 3) 우리는 발굴된 부분 네트워크에서 기능적 최소 단위인 네트워크 모티프를 동정하였다. 그 결과, 피드포워드(FFL: feedforward) 모티프가 가장 지배적인 구조임을 밝혀냈고 이들의 세부 구조에 대한 특성을 알아보았다. 종합적으로, 꽃 조직은 coherent FFL와 incoherent FFL의 조합으로 구성되어 있다는 것을 확인했다. coherent FFL 구조는 꽃 조직으로 하여금 안정적인 개화 반응을 유도할 수 있게 하며, 반면에 incoherent FFL 구조는 외부 환경 변화에 빠르게 적응(adaptation)하여, 항상성 (homeostasis)을 유지하려는 특성의 원천이 될 것으로 여겨진다.
더보기Chinese cabbage (Brassica rapa ssp. Pekinensis) is one of the most important horticultural crops in Asian countries. It is well known that the developmental process is usually determined by the complex interactions between genes. Therefore, it is also very important to understand the developmental process of Chinese cabbage by studying the dynamics of the gene regulatory networks in the cells constituting the of cabbage. We found that the coherent and incoherent feedforward loops were significantly enriched in flower tissue. By exploring the dynamic characteristics of feedforward and feedback loops, we concluded that flower tissue was designed to be more robust (coherent FFL), be more adaptive to various input signals(incoherent FFL). We believe that our approach using network information of the evolutionary nearest model organism is helpful to understand the underlying mechanisms of yet widely unknown organisms.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2023 | 평가예정 | 재인증평가 신청대상 (재인증) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (재인증) | KCI등재 |
2019-12-01 | 평가 | 등재후보로 하락 (계속평가) | KCI후보 |
2016-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (계속평가) | KCI등재 |
2015-12-01 | 평가 | 등재후보로 하락 (기타) | KCI후보 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-02-20 | 학술지명변경 | 한글명 : 한국퍼지및지능시스템학회 논문지 -> 한국지능시스템학회 논문지외국어명 : 미등록 -> Journal of Korean Institute of Intelligent Systems | KCI등재 |
2008-02-18 | 학회명변경 | 한글명 : 한국퍼지및지능시스템학회 -> 한국지능시스템학회영문명 : Korea Fuzzy Logic And Intelligent Systems Society -> Korean Institute of Intelligent Systems | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2005-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2002-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
1999-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.62 | 0.62 | 0.63 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.56 | 0.49 | 0.866 | 0.2 |
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