KCI등재
SCIE
SCOPUS
Hepatic microRNAome reveals potential microRNA-mRNA pairs association with lipid metabolism in pigs
저자
Jingge Liu (College of Animal Science and Technology, Nanjing Agricultural University, China) ; Caibo Ning (College of Animal Science and Technology, Nanjing Agricultural University, China) ; Bo-jiang Li (Nanjing Agricultural University, China) ; Rongyang Li (College of Animal Science and Technology, Nanjing Agricultural University, China) ; Wang Jun Wu (Nanjing Agricultural University) ; Honglin Liu (Nanjing Agricultural University) 연구자관계분석
발행기관
학술지명
Animal Bioscience (ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES)
권호사항
발행연도
2019
작성언어
English
주제어
KDC
527
등재정보
KCI등재,SCIE,SCOPUS
자료형태
학술저널
수록면
1458-1468(11쪽)
KCI 피인용횟수
1
DOI식별코드
제공처
Objective: As one of the most important metabolic organs, the liver plays vital roles in modulating the lipid metabolism. This study was to compare miRNA expression profiles of the Large White liver between two different developmental periods and to identify candidate miRNAs for lipid metabolism.
Methods: Eight liver samples were collected from White Large of 70-day fetus (P70) and of 70-day piglets (D70) (with 4 biological repeats at each development period) to construct sRNA libraries. Then the eight prepared sRNA libraries were sequenced using Illumina next-generation sequencing technology on HiSeq 2500 platform.
Results: As a result, we obtained 346 known and 187 novel miRNAs. Compared with the D70, 55 down- and 61 up-regulated miRNAs were shown to be significantly differentially expressed (DE). Gene ontology and Kyoto encyclopedia of genes and genomes enrichment analysis indicated that these DE miRNAs were mainly involved in growth, development and diverse metabolic processes. They were predicted to regulate lipid metabolism through adipocytokine signaling pathway, mitogen-activated protein kinase, AMP-activated protein kinase, cyclic adenosine monophosphate, phosphatidylinositol 3 kinase/protein kinase B, and Notch signaling pathway. The four most abundantly expressed miRNAs were miR-122, miR-26a and miR-30a-5p (miR-122 only in P70), which play important roles in lipid metabolism. Integration analysis (details of mRNAs sequencing data were shown in another unpublished paper) revealed that many target genes of the DE miRNAs (miR-181b, miR-145-5p, miR-199a-5p, and miR-98) might be critical regulators in lipid metabolic process, including acyl-CoA synthetase long chain family member 4, ATP-binding casette A4, and stearyl-CoA desaturase. Thus, these miRNAs were the promising candidates for lipid metabolism.
Conclusion: Our study provides the main differences in the Large White at miRNA level between two different developmental stages. It supplies a valuable database for the further function and mechanism elucidation of miRNAs in porcine liver development and lipid metabolism.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2021-01-01 | 학술지명변경 | 한글명 : ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES -> Animal Bioscience외국어명 : ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES -> Animal Bioscience | KCI등재 |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2013-10-01 | 평가 | SCI 등재 (등재유지) | KCI등재 |
2013-10-01 | 평가 | SCOPUS 등재 (등재유지) | KCI등재 |
2012-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (기타) | KCI후보 |
2011-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2009-12-29 | 학회명변경 | 한글명 : 아세아ㆍ태평양축산학회 -> 아세아·태평양축산학회 | KCI후보 |
2005-09-28 | 학술지명변경 | 한글명 : 아세아태평양축산학회지 -> ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES | KCI후보 |
2003-01-01 | 평가 | SCIE 등재 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 1.03 | 0.23 | 0.76 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.6 | 0.5 | 0.367 | 0.04 |
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