KCI등재후보
백년초선인장의 ITS(internal transcribed spacer) 유전자 분석 = Analysis of the ITS (Internal Transcribed Spacer) Region of Opuntia ficus-indica
저자
인준교(Jun-Gyo In) ; 이범수(Bum-Soo Lee) ; 김은정(Eun-Jeong Kim) ; 최관삼(Kwan-Sam Choi) ; 한승호(Seung-Ho Han) ; 신철우(Cheol-Woo Shin) ; 양덕춘(Deok-Chun Yang)
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2006
작성언어
-주제어
KDC
480
등재정보
KCI등재후보
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
161-168(8쪽)
KCI 피인용횟수
7
제공처
To investigate the origin of backyeoncho (Opuntia ficus-indica var. saboten), we isolated 685 bp clone using ITS primer pairs. The rDNA consists of the genes coding for the partial 54 bp 185, 162 bp 5.8S, and partial 56 bp 26S. The coding regions are interrupted by two internal transcribed spacers, 193 bp ITS1 and 220 bp ITS2. The ITS2 of backnyeoncho in length was shorter than that previously registered in Cucurbitoideae plants. The GC contents was 66.8% in ITS1, and 67.7% in ITS2. The rDNA of backnyeoncho matched to the previously reported genes and showed a high similarity with the 95% identity with Pereskiopsis porteri (L708037). In the phylogenetic analysis, the backnyeoncho rDNA was clustered with Pereskiopsis porteri (L708037).
더보기제주도에 자생하는 부채 선인장인 백년초의 기원 규명을 목적으로 ITS primer를 이용하여 685 bp의 ITS 영역을 분리하였다. ITS 영역의 염기서열을 분석한 결과 18S rRNA의 길이는 54 bp, 26S rRNA는 55 bp, ITS1은 193 bp, ITS2는 220 bp로 구성되어 있었다. 백년초 ITS 영역은 기존에 보고된 Cucurbitoideae 식물들의 ITS 영역에 비하여 ITS2 스페이서 영역의 239-254 bp보다는 다소 짧았다. 그러나 이들 스페이서 영역의 GC 함량은 백년초의 경우 ITS1은 66.8%, ITS2의 경우에는 67.7%로 Cucurbitoideae 식물들에서 보다 높은 GC 함량을 나타내었다. 백년초 선인장의 rDNA 영역에 가장 높은 상동성을 나타낸 것은 같은 Opuntioideae에 속하는 Pereskiopsis porteri(L78037)로 95%의 유사도를 나타내었다. 백년초 rDNA Clustal W 프로그램을 이용하여 유연관계를 조사한 결과 같은 Opuntioideae에 속하는 Pereskiopsis porteri(L78037)와 같은 cluster로 분리되었다.
더보기분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2022 | 평가예정 | 재인증평가 신청대상 (재인증) | |
2019-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (계속평가) | KCI등재 |
2016-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (계속평가) | KCI등재 |
2012-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2008-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2007-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 FAIL (등재후보1차) | KCI후보 |
2006-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
2005-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
2003-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.77 | 0.77 | 0.77 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.74 | 0.67 | 1.157 | 0.27 |
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