Evaluation of <i>TRAF6</i> in a large multiancestral lupus cohort
저자
Namjou, Bahram ; Choi, Chan‐ ; Bum ; Harley, Isaac T. W. ; Alarcó ; n‐ ; Riquelme, Marta E. ; Kelly, Jennifer A. ; Glenn, Stuart B. ; Ojwang, Joshua O. ; Adler, Adam ; Kim, Kwangwoo ; Gallant, Caroline J. ; Boackle, Susan A. ; Criswell, Lindsey A. ; Kimberly, Robert P. ; Brown, Elizabeth E. ; Edberg, Jeffrey ; Alarcó ; n, Graciela S. ; Stevens, Anne M. ; Jacob, Chaim O. ; Gilkeson, Gary S. ; Kamen, Diane L. ; Tsao, Betty P. ; Anaya, Juan‐ ; Manuel ; Kim, Eun‐ ; Mi ; Park, So‐ ; Yeon ; Sung, Yoon‐ ; Kyoung ; Guthridge, Joel M. ; Merrill, Joan T. ; Petri, Michelle ; Ramsey‐ ; Goldman, Rosalind ; Vilá ; , Luis M. ; Niewold, Timothy B. ; Martin, Javier ; Pons‐ ; Estel, Bernardo A. ; Vyse, Timothy J. ; Freedman, Barry I. ; Moser, Kathy L. ; Gaffney, Patrick M. ; Williams, Adrienne H. ; Comeau, Mary E. ; Reveille, John D. ; Kang, Changwon ; James, Judith A. ; Scofield, R. Hal ; Langefeld, Carl D. ; Kaufman, Kenneth M. ; Harley, John B. ; Bae, Sang&
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2012
작성언어
-자료형태
학술저널
수록면
1960-1969(10쪽)
제공처
<P><B>Abstract</B></P><P><B>Objective</B></P><P>Systemic lupus erythematosus (SLE) is a heterogeneous autoimmune disease with significant immune system aberrations resulting from complex heritable genetics as well as environmental factors. We undertook to study the role of <I>TRAF6</I> as a candidate gene for SLE, since it plays a major role in several signaling pathways that are important for immunity and organ development.</P><P><B>Methods</B></P><P>Fifteen single‐nucleotide polymorphisms (SNPs) across <I>TRAF6</I> were evaluated in 7,490 SLE patients and 6,780 control subjects from different ancestries. Population‐based case–control association analyses and meta‐analyses were performed. <I>P</I> values, false discovery rate q values, and odds ratios (ORs) with 95% confidence intervals (95% CIs) were calculated.</P><P><B>Results</B></P><P>Evidence of associations was detected in multiple SNPs. The best overall <I>P</I> values were obtained for SNPs rs5030437 and rs4755453 (<I>P</I> = 7.85 × 10<SUP>−5</SUP> and <I>P</I> = 4.73 × 10<SUP>−5</SUP>, respectively) without significant heterogeneity among populations (<I>P</I> = 0.67 and <I>P</I> = 0.50, respectively, in Q statistic). In addition, SNP rs540386, which was previously reported to be associated with rheumatoid arthritis (RA), was found to be in linkage disequilibrium with these 2 SNPs (r<SUP>2</SUP> = 0.95) and demonstrated evidence of association with SLE in the same direction (meta‐analysis <I>P</I> = 9.15 × 10<SUP>−4</SUP>, OR 0.89 [95% CI 0.83–0.95]). The presence of thrombocytopenia improved the overall results in different populations (meta‐analysis <I>P</I> = 1.99 × 10<SUP>−6</SUP>, OR 0.57 [95% CI 0.45–0.72], for rs5030470). Finally, evidence of family‐based association in 34 African American pedigrees with the presence of thrombocytopenia was detected in 1 available SNP (rs5030437) with a Z score magnitude of 2.28 (<I>P</I> = 0.02) under a dominant model.</P><P><B>Conclusion</B></P><P>Our data indicate the presence of association of <I>TRAF6</I> with SLE, consistent with the previous report of association with RA. These data provide further support for the involvement of <I>TRAF6</I> in the pathogenesis of autoimmunity.</P>
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