KCI등재
SCOPUS
SCIE
Estimates of linkage disequilibrium and effective population sizes in Chinese Merino (Xinjiang type) sheep by genome-wide SNPs
저자
Shudong Liu (Shihezi University) ; Sangang He (Xinjiang Academy of Animal Science) ; Lei Chen (Xinjiang Academy of Animal Science) ; Wenrong Li (Xinjiang Academy of Animal Science) ; Jiang Di (Xinjiang Academy of Animal Sciences) ; Mingjun Liu (Xinjiang Academy of Animal Science) 연구자관계분석
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2017
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재,SCOPUS,SCIE
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
733-745(13쪽)
KCI 피인용횟수
14
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Knowledge of linkage disequilibrium (LD) is important for effective genome-wide association studies and accurate genomic prediction. Chinese Merino (Xinjiang type) is well-known fine wool sheep breed. However, the extent of LD across the genome remains unexplored. In this study, we calculated autosomal LD based on genomewide SNPs of 635 Chinese Merino (Xinjiang type) sheep by Illumina Ovine SNP50 BeadChip. A moderate level of LD (r2 ≥ 0.25) across the whole genome was observed at short distances of 0–10 kb. Further, the ancestral effective population size (Ne) was analyzed by extent of LD and found that Ne increased with the increase of generations and declined rapidly within the most recent 50 generations, which is consistent with the history of Chinese Merino sheep breeding, initiated in 1971. We also noted that even when the effective population size was estimated across different single chromosomes, Ne only ranged from 140.36 to 183.33 at five generations in the past, exhibiting a rapid decrease compared with that at ten generations in the past. These results indicated that the genetic diversity in Chinese Merino sheep recently decreased and proper protective measures should be taken to maintain the diversity.
Our datasets provided essential genetic information to track molecular variations which potentially contribute to phenotypic variation in Chinese Merino sheep.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2015-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2012-05-07 | 학술지명변경 | 한글명 : 한국유전학회지 -> Genes & Genomics | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-04-14 | 학술지명변경 | 외국어명 : Korean Journal of Genetics -> Genes and Genomics | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2003-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2002-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
1999-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.51 | 0.12 | 0.38 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.32 | 0.27 | 0.258 | 0.02 |
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