SCOPUS
KCI등재
원주지역 설사 환자에서 분리한 Small Round Structured Viruses ( SRSV ) 염기서열 분석
저자
지영미(Young Mi Jee) ; 김기순(Gee Sun Kim) ; 천두성(Doo Sung Chun) ; 박정구(Jung Goo Park) ; 강영화(Young Hwa Kang) ; 정윤석(Yoon Suk Jung) ; 고운영(Woon Young Ko) ; 신영학(Young Hak Shin) ; 윤재득(Jae Deuk Yoon)
발행기관
학술지명
Journal of Bacteriology and Virology(Journal of Bacteriology and Virology)
권호사항
발행연도
1999
작성언어
Korean
주제어
KDC
475
등재정보
SCOPUS,KCI등재
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
247-260(14쪽)
제공처
Small round structured viruses (SRSV) are the major ethological agents which can cause outbreaks of non-bacterial gastroenteritis or food poisoning both in children and adults. The classification of family Caliciviridae to which SRSV belong, is based on the genome encoding three open reading frames. The rotavirus is another major pathogen which causes diarrhea in young children. We examined stool specimens obtained from diarrheal patients in Wonju from which bacterial pathogens were not found. To detect causative viruses from stool specimens of patients, reverse transcription (RT)-polymerase chain reaction (PCR) or nested PCR using rotavirus or SRSV specific primers was performed. In this study, RT-nested PCR procedure which can amplify a 330 bp fragment derived from RNA dependent RNA polymerase (RDRP) region within ORF1 was applied for the detection of SRSV. For the detection of rotaviruses, a 877 bp fragment from the VP4 region of rotavirus genome was amplified. As a result, rotavirus was not detected while SRSV sequences were detected from one out of five specimens. The nucleotide and amino acid sequences of the Wonju isolate were compared with other 6 Korean isolates which have been isolated and sequenced in our laboratory. Sequence analysis revealed that the Wonju isolate was rather distinct from other Korean isolates: the Wonju isolate was closer to genogroup I of SRSV while other 6 Korean isolates belonged to genogroup II.
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