KCI등재
SCOPUS
SCIE
Methylation Signature for Prediction of Progression Free Survival in Surgically Treated Clear Cell Renal Cell Carcinoma
저자
Kang, Ho Won ; Park, Hongyong ; Seo, Sung Pil ; Byun, Young Joon ; Piao, Xuan-Mei ; Kim, Sung Min ; Kim, Won Tae ; Yun, Seok-Joong ; Jang, Wooyeong ; Shon, Ho Sun ; Ryu, Keun Ho ; Lee, Sang-Cheol ; Kim, Wun-Jae ; Kim, Yong-June
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2019
작성언어
-주제어
등재정보
KCI등재,SCOPUS,SCIE
자료형태
학술저널
수록면
e144
제공처
<P><B>Background</B></P><P>Little is known about epigenetic silencing of genes by promoter hypermethylation in renal cell carcinoma (RCC). The aim of this study was to identify prognostic methylation markers in surgically treated clear cell RCC (ccRCC).</P><P><B>Methods</B></P><P>Methylation patterns were assayed using the Infinium HumanMethylation450 BeadChip array on pairs of ccRCC and normal tissue from 12 patients. Using quantitative PSQ analysis, tumor-specific hypermethylated genes were validated in 25 independent cohorts and their clinical relevance was also verified in 152 independent cohorts.</P><P><B>Results</B></P><P>Using genome-wide methylation array, Zinc finger protein 278 (<I>ZNF278</I>), Family with sequence similarity 155 member A (<I>FAM155A</I>) and Dipeptidyl peptidase 6 (<I>DPP6</I>) were selected for tumor-specific hypermethylated genes in primary ccRCC. The promoter methylation of these genes occurred more frequently in ccRCC than normal kidney in independent validation cohort. The hypermethylation of three genes were associated with advanced tumor stage and high grade tumor in ccRCC. During median follow-up of 39.2 (interquartile range, 15.4–79.1) months, 22 (14.5%) patients experienced distant metastasis. Multivariate analysis identified the methylation status of these three genes, either alone, or in a combined risk score as an independent predictor of distant metastasis.</P><P><B>Conclusion</B></P><P>The promoter methylation of <I>ZNF278</I>, <I>FAM155A</I> and <I>DPP6</I> genes are associated with aggressive tumor phenotype and early development of distant metastasis in patients with surgically treated ccRCC. These potential methylation markers, either alone, or in combination, could provide novel targets for development of individualized therapeutic and prevention regimens.</P>
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