SCOPUS
KCI등재
Infectious bursal disease virus(국내분리주)의 variable VP2 gene의 분석 = Sequence analysis of the variable VP2 gene of infectious bursal disease viruses isolated in Korea
저자
권혁무 (강원대학교 수의학과) ; 김대규 (강원대학교 수의학과) ; 성환우 (국립수의과학검역원) ; Kwon, Hyuk-moo ; Kim, Dae-kyu ; Seong, Hwan-woo
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
1999
작성언어
Korean
주제어
등재정보
SCOPUS,KCI등재
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
545-553(9쪽)
제공처
소장기관
A 474-base pair segment covering the hypervariable region of VP2 gene from six Korean infectious bursal disease virus(K-IBDV) isolates(K1, K2, SH/92, 225, 269, 310) and one attenuated IBDV(DAE) were amplified using RT-PCR, sequenced, and compared with published sequences for IBDV. K-IBDV isolates(K1, K2, SH/92, 225, 269) and foreign very virulent(vv) IBDV strains had 94.93~100% amino acid sequence similarity. K-IBDV isolate 310 and other K-IBDV isolates had 84.31~86.07% amino acid sequence similarity. Attenuated strain(DAE), like other attenuated strain, has substitution at positions 279(D to N) and 284(A to T) as well as in the serine-rich heptapeptide region. Five K-IBDV isolates except 310 isolate share unique amino acid residues at positions 222(A), 256(I), 294(I) which are not present in other standard and attenuated strains. At the two hydrophilic region, K-IBDV isolates except 310 isolate had identical amino acids comparing with Belgium vv IBDV 894VB but had four amino acid substitutions comparing with Chinese vv IBDV F9502. The SWSASGS heptapeptide is conserved in all K-IBDV isolates. The sequence of K-IBDV isolate 310 was markedly different from other IBDV strains, evolving from a separate lineage than the others. By phylogenetic analysis, Five K-IBDV isolates except 310 isolate were categorized in one group with foreign vv IBDV isolates but K-IBDV isolate 310 was categorized in a separate group which was differentiated from other compared IBDV strains.
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