KCI등재
SCOPUS
Complete genome sequence of Celluosilyticum lentocellum WCF-2 isolated from cow dung
저자
허준 (국립농업과학원 농업미생물과) ; 유재홍 (국립농업과학원) ; 박인철 (국립농업과학원) ; 한병학 (국립농업과학원) ; 권순우 (국립농업과학원 농업미생물과) ; 안재형 (국립농업과학원) ; Heo, Jun ; You, Jaehong ; Park, InCheol ; Han, Byeong-Hak ; Kwon, Soon-Wo ; Ahn, Jae-Hyung 연구자관계분석
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2019
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English
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KCI등재,SCOPUS
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313-315(3쪽)
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사일리지 제조에 사용하기 위한 섬유소 분해균을 탐색하는 중 절대혐기성 세균인 WCF-2 균주를 선발하였다. WCF-2 균주는 16S rRNA 유전자 염기서열 유사도가 가장 높은(98.2%) 표준균주인 Cellulosilyticum lentocellum DSM $5427^T$ 보다 높은 섬유소 분해 활성을 나타내었다. WCF-2 균주의 전체 유전체 염기서열을 분석하고 이를 C. lentocellum DSM $5427^T$와 비교하였을 때 두 균주의 OrthoANI 값은 97.9%로 나타나 WCF-2를 C. lentocellum으로 동정하였다. WCF-2 균주의 유전체 크기는 4,779,774 bp이고 G + C 함량은 34.4%였으며 4,154개의 단백질 암호화 유전자 및 142개의 RNA 암호화 유전자를 보유하고 있었다. 또한 WCF-2 균주는 7개의 cellulase를 보유하고 있었으며 이 중 5개는 C. lentocellum DSM $5427^T$의 cellulase와 낮은 유사도를 나타내었다.
더보기An anaerobic bacterial strain WCF-2 was isolated from cow dung in finding cellulose-degrading bacteria for use as silage additives. Strain WCF-2 showed a higher cellulolytic activity than Cellulosilyticum lentocellum DSM $5427^T$, the closest relative of strain WCF-2 (98.2% of 16S rRNA gene sequence similarity). We sequenced the complete genome of strain WCF-2 and compared it with that of C. lentocellum DSM $5427^T$. The OrthoANI value between the two strains was 97.9% thus strain WCF-2 was identified as C. lentocellum. The genome size of strain WCF-2 was 4,779,774 bp with a G + C content of 34.4%, 4,154 coding genes (CDS), 54 pseudo genes, and 142 RNA genes. Strain WCF-2 harbored seven cellulase genes, five of which showed low similarities with those of C. lentocellum DSM $5427^T$.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2013-12-02 | 학술지명변경 | 외국어명 : The Korean Journal of Microbiology -> Korean Journal of Microbiology | KCI등재 |
2010-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2006-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2001-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
1998-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.21 | 0.21 | 0.21 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.26 | 0.24 | 0.48 | 0.02 |
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