KCI등재
SCOPUS
SCIE
Investigation of high correlation with carcass traits of SNPs of the PLCB1, C/EBPα, and TDRKH genes and the combinations of SNPs using the MDR method in the Hanwoo
저자
Kim Songmi (Dankook University) ; Lee Yong-Moon (Dankook University College of Medicine) ; Kim Dong Hee (Dankook University Hospital) ; Ha Jae Jung (Livestock Research Institute) ; 이준구 (한경국립대학교) ; 김대현 (경상북도 축산기술연구소) ; Oh Dongyep (Livestock Research Institute) ; 한규동 (단국대학교)
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2021
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English
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KCI등재,SCOPUS,SCIE
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학술저널
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961-973(13쪽)
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Background Recently, many researchers focus on the best way to produce high-quality meat, as the trend in food consumption today is to focus on quality. In general, consumers’ preferences in beef difer depending on taste and meatiness. Therefore, researchers are interested in how the marbling score afects the favors of meat or the various factors that make up the meatiness to captivate the consumers’ tastes.
Objective This study identifes single nucleotide polymorphisms (SNPs) or gene combinations that afect the carcass traits of Korean cattle (Hanwoo) by using the multifactor dimensionality reduction (MDR) method.
Methods We collected the candidate SNPs to identify SNPs related to marbling scores from whole-exome sequencing and bovine SNP genotyping data. Using 96 Hanwoo samples, we performed PCR amplifcation to investigate the polymorphism status. In addition, we investigated genetic relationships between carcass traits and SNPs using 612 Hanwoo samples. Furthermore, each candidate SNP genotype and the combinations of SNP genotypes were verifed to improve the accuracy of genetic relationships using MDR method.
Results Twenty-four candidate SNPs associated with carcass trait and marbling scores were identifed from SNP genotyping and whole-exome sequencing. Among them, three SNP markers (c.459 T>C of the PLCB1 gene, c.271 A>C of the C/EBPα gene, and g.17257 A>G of the TDRKH gene) were showed statistically signifcant diferences between intramuscular fat and genotypes. Especially, two candidate SNPs, including c.459 T>C located in the PLCB1 gene and c.271 A>C located in the C/ EBPα gene, could be highly associated with the intramuscular fat of Hanwoo quality grade. In addition, the combination of SNP genotypes is showed higher signifcant diferences with carcass weight, backfat thickness, and longissimus dorsi muscle area.
Conclusion Three SNP genotypes and the combination of SNP genotypes in the PLCB1, C/EBPα, and TDRKH genes may be useful genetic markers for improving beef quality.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2015-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2012-05-07 | 학술지명변경 | 한글명 : 한국유전학회지 -> Genes & Genomics | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-04-14 | 학술지명변경 | 외국어명 : Korean Journal of Genetics -> Genes and Genomics | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2003-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2002-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
1999-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.51 | 0.12 | 0.38 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.32 | 0.27 | 0.258 | 0.02 |
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