HIV-1 Non-Nucleoside 역전사 효소 억제제의 생물학적 활성과 3차원 구조사이의 정량적 상관관계(3D-QSAR) 연구 = 3D-Quantitative Structure-Activity Relationship(3D-QSAR) Study of non nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors(NNRTIs) as HIV-1
본 연구에서는 AIDS라고 잘 알려진 후천성 면역 결핍(부전)증후군(Acquired Immuno Deficiency Syndrome)의 치료제로 사용될 수 있는 NNRTIs(Non-nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors)에 대해, 3D-QSAR방법으로 이들의 약리단(phrmacophore model)을 정의하고자 한다. NNRTIs는 HIV의 유전물질이 건강한 세포로 옮겨 갈 수 없도록 역 전사효소에 달라붙어 DNA합성을 방해함으로써 HIV의 증식을 막는다. 이들의 대표적인 화합물들은 HEPT(Hydroxyethoxymethylphenylthiothymine), TIBO(tetrahydroimidazo-benzodiazepinone), Nevirapine 등으로, 이들이 이번 연구에 사용된 화합물들이다. 지금까지의 연구에서는 이들의 결합 모형을 각각 연구 해 왔지만 X-ray 구조를 보면 NNRTI들이 역 전사 효소의 결합부위와 상호 작용할 때 유사한 입체구조를 갖는다고 할 수 있다. 따라서 이번 연구에서는 이러한 사실을 확인하기 위해 3D-QSAR 방법을 이용하여 NNRTIs 각각의 약리성 자리와 3차원 입체구조를 X-ray 구조와 비교, 분석하였다. 마지막으로, 이렇게 해서 얻은 활성가설을 하나의 '분자 체'로 이용하여 National Cancer Institute(NCI)의 AIDS관련 화합물들로 이루어진 데이터 베이스를 검색함으로써 선도물질이 될 수 있는 구조들을 검색해 보았다.
A definition of pharmacophore for the NNRTIs(Non-Nuceoside Reverse Transcripase Inhibitors) was carried by considering a 3D-QSAR model. HEFT (hydroxyethoxy -methylphenylthiothymine), TIBO(tetrahydroimidazobenzodiazepinone) and Nevirapine among NNRTIs were used in this study. Pharmacophore models generated for the NNRTI binding pocket have been usually limited so far to a single class of compound. But NNRTIs have all been shown by X-ray crystallography to share a common binding location. Then, these inhibitors seem general similar conformation when bound to the pocket of RT. It has been confirmed that the similar interactions between the three class inhibitors have been shown by superimposing of pharmacophore models. The 3D-pharmacophore models as molecule sieve was applied in NCI database in order to find the potent inhibitors. The results provided a good basis to design new inhibitors of HIV-1 RT.
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