에어컨에서 분리한 박테리아 Flexivirga aerilata ID2601ST의 게놈 서열 초안 = Draft genome sequence of Flexivirga aerilata ID2601ST isolated from automobile air conditioning system

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

A Gram-staining-positive, aerobic bacterium, non-motile, nearlycoccoid strain, designated ID2601ST, was isolated from the surface of the climatronic evaporator core, which is in the automobile. The strain ID2601ST grow optimally at 35°C, pH 7.0 and without NaCl. In this study, we report the draft genome sequence of a Flexivirga aerilata ID2601ST obtained using the Illumina MiSeq platform. The genome comprised of 4,007,297 bp which was assembled in 6 contigs. The N50 value of strain ID2601ST was 2,524,017 bp with genome coverage of 258.07 X.
The G + C content of 69.8%, the genome included 3,784 genes were predicted, among them, 3,673 genes are protein-coding genes. Also, the genome of F. aerilata (= KCTC 49353T = NBRC 114622T) contained genes encoding enzymes necessary for phenylalanine, tyrosine, and tryptophan biosynthesis.
Moreover, the gene encoding dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5- epimerase, which synthesizes the antibiotic streptomycin, was found.

국문 초록 (Abstract)

ID2601ST로 명명된 균주는 그람 염색 양성 호기성 세균으로 비운동성으로 구균에 가까운 형태를 나타내며 자동차공조시스템의 증발기 표면에서 분리되었으며 해당 균주는 35°C, pH 7.0, NaCl이 없는 곳에서 최적으로 성장한다. 이번 연구에서 Illumina MiSeq 플랫폼을 사용하여 얻은 박테리아 Flexivirga aerilata ID2601ST의 유전체 염기서열을 보고한다. 해당균주의 유전체는 6개의 contig로 구성된 4,007,297 bp의 크기를 가지며 N50 값은 2,524,017 bp로 258.07 X의 배율로 분석되었다. G + C 함량은 69.8%로 3,784개의 유전자를 포함하는게놈이 예측되었으며, 이 중 3,673개의 유전자가 단백질 코딩유전자로 예상된다. 또한, F. aerilata (= KCTC 49353T = NBRC 114622T)의 유전체는 페닐 알라닌, 티로신 및 트립토판 생합성에 필요한 효소를 코팅하는 유전자를 포함한다. 뿐만 아니라항생제 스트렙토마이신을 합성하는 dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase를 코딩하는 유전자를 암호화한다.

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