SCIE
SCOPUS
KCI등재
Identification and Characterization of a Putative Baculoviral Transcriptional Factor IE-1 from Choristoneura fumiferana Granulovirus = Identification and Characterization of a Putative Baculoviral Transcriptional Factor IE-1 from Choristoneura fumiferana Granulovirus
저자
발행기관
생화학분자생물학회(Korean Society for Biochemistry and Molecular Biology)
학술지명
권호사항
발행연도
2002
작성언어
-주제어
KDC
400
등재정보
SCIE,SCOPUS,KCI등재
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
553-561(9쪽)
제공처
A gene that encodes a protein homologue to baculoviral IE-1 was identified and sequenced in the genome of the Choristoneura fumiferana granulovirus (ChfuGV). The gene has an 1278 nucleotide (nt) open-reading frame (ORF) that encodes 426 amino acids with an estimated molecular weight of 50.33 kDa. At the nucleotide level, several cis-acting regulatory elements were detected within the promoter region of the ie-1 gene of ChfuGV along with other studied granuloviruses (GVs). Two putative CCAAT elements were detected within the noncoding leader region of this gene; one was located on the opposite strand at -92 and the other at -420 nt from the putative start triplet. Two baculoviral late promoter motifs (TAAG) were also detected within the promoter region of the ie-1 gene of ChfuGV. A single polyadenylation signal, AATAAA, was located 18nt downstream of the putative translational stop codon of ie-1 from ChfuGV. At the protein level, the amino acid sequence data that was derived from the nucleotide sequence in ChfuGV IE-1 was compared to those of the Cydia pomonella granulovirus (CpGV), Xestia c-nigrum granulovirus (XcGV) and Plutella xylosteila granulovirus (PxGV). The C-terminal regions of the granuloviral IE-1 sequences appeared to be more conserved when compared to the N-terminal regions. A domain, similar to the basic helix-loop-helix like (bHLH-like) domain in NPVs, was detected at the C-terminal region of IE-1 from ChfuGV (residues 387 to 414). A phylogenetic tree for baculoviral IE-1 was constructed using a maximum parsimony analysis, A phylogenetic estimation demonstrates that ChfuGV IE-1 is most closely related to that of CpGV.
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