부호화 엔트로피를 이용한 Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 박테리아 게놈 서열의 기능적 분류 = Functional classification of genome sequences in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 bacteria by using symbolic entropy
저자
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2006
작성언어
Korean
KDC
051.000
자료형태
학술저널
수록면
283-294(12쪽)
제공처
샤논의 정보 이론을 이용하여 완전한 게놈이 밝혀진 그램 양성박테리아 Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 로부터 얻은 DNA 서열의 기능을 분류하고 특성을 조사하였다. 염기의 구조와 결합방식에 따라 부호화된 DNA 서열에서 겹침 없이 3개의 부호를 하나의 무늬로 구성하여 누적 무늬 분포와 보정된 정보 엔트로피를 계산하였다. 논 코딩 영역의 누적 무늬는 길이에 관계없이 코딩영역보다 균등한 분포를 가지며, 엔트로피는 논 코딩 영역이 코딩영역보다 통계적으로 큰 값을 나타났다. 실재 DNA 서열의 구성 염기의 개수를 일치시킨 대체 서열들을 이용하여 대체 데이터 검사를 실시한 결과 DNA 서열이 대체 서열과 통계적으로 유의하게 구분됨을 확인하였다. 누적 무늬 분포와 보정된 정보 엔트로피의 평가는 DNA 서열의 생물학적 기능을 구분하는데 이용될 수 있음을 제시하였다.
더보기By using Shannon's information entropy we investigated the functional classification and characterization of symbolic sequences generated from complete DNA sequence of gram positive bacteria Corynebacterium glutamicum ATCC 13032. Cumulative distribution of words and the corrected information entropy were estimated from non-overlapping windows of triplet in symbolic sequence, in which bases in DNA sequence were symbolized according to the structure of nucleic acids and the type of bonding. For coding and non-coding sequences in all ranges of length, non coding sequences always had more uniform distribution of cumulative words and statistically higher entropy value than coding sequences. Through surrogate data test, where the number of bases was kept constant, we found that real DNA sequences were statistically significantly discriminated from the surrogate sequences. Cumulative distribution of words and estimation of corrected entropy might play some role in classifying biological functioning in DNA sequences of complete genome of bacteria.
더보기서지정보 내보내기(Export)
닫기소장기관 정보
닫기권호소장정보
닫기오류접수
닫기오류 접수 확인
닫기음성서비스 신청
닫기음성서비스 신청 확인
닫기이용약관
닫기학술연구정보서비스 이용약관 (2017년 1월 1일 ~ 현재 적용)
학술연구정보서비스(이하 RISS)는 정보주체의 자유와 권리 보호를 위해 「개인정보 보호법」 및 관계 법령이 정한 바를 준수하여, 적법하게 개인정보를 처리하고 안전하게 관리하고 있습니다. 이에 「개인정보 보호법」 제30조에 따라 정보주체에게 개인정보 처리에 관한 절차 및 기준을 안내하고, 이와 관련한 고충을 신속하고 원활하게 처리할 수 있도록 하기 위하여 다음과 같이 개인정보 처리방침을 수립·공개합니다.
주요 개인정보 처리 표시(라벨링)
목 차
3년
또는 회원탈퇴시까지5년
(「전자상거래 등에서의 소비자보호에 관한3년
(「전자상거래 등에서의 소비자보호에 관한2년
이상(개인정보보호위원회 : 개인정보의 안전성 확보조치 기준)개인정보파일의 명칭 | 운영근거 / 처리목적 | 개인정보파일에 기록되는 개인정보의 항목 | 보유기간 | |
---|---|---|---|---|
학술연구정보서비스 이용자 가입정보 파일 | 한국교육학술정보원법 | 필수 | ID, 비밀번호, 성명, 생년월일, 신분(직업구분), 이메일, 소속분야, 웹진메일 수신동의 여부 | 3년 또는 탈퇴시 |
선택 | 소속기관명, 소속도서관명, 학과/부서명, 학번/직원번호, 휴대전화, 주소 |
구분 | 담당자 | 연락처 |
---|---|---|
KERIS 개인정보 보호책임자 | 정보보호본부 김태우 | - 이메일 : lsy@keris.or.kr - 전화번호 : 053-714-0439 - 팩스번호 : 053-714-0195 |
KERIS 개인정보 보호담당자 | 개인정보보호부 이상엽 | |
RISS 개인정보 보호책임자 | 대학학술본부 장금연 | - 이메일 : giltizen@keris.or.kr - 전화번호 : 053-714-0149 - 팩스번호 : 053-714-0194 |
RISS 개인정보 보호담당자 | 학술진흥부 길원진 |
자동로그아웃 안내
닫기인증오류 안내
닫기귀하께서는 휴면계정 전환 후 1년동안 회원정보 수집 및 이용에 대한
재동의를 하지 않으신 관계로 개인정보가 삭제되었습니다.
(참조 : RISS 이용약관 및 개인정보처리방침)
신규회원으로 가입하여 이용 부탁 드리며, 추가 문의는 고객센터로 연락 바랍니다.
- 기존 아이디 재사용 불가
휴면계정 안내
RISS는 [표준개인정보 보호지침]에 따라 2년을 주기로 개인정보 수집·이용에 관하여 (재)동의를 받고 있으며, (재)동의를 하지 않을 경우, 휴면계정으로 전환됩니다.
(※ 휴면계정은 원문이용 및 복사/대출 서비스를 이용할 수 없습니다.)
휴면계정으로 전환된 후 1년간 회원정보 수집·이용에 대한 재동의를 하지 않을 경우, RISS에서 자동탈퇴 및 개인정보가 삭제처리 됩니다.
고객센터 1599-3122
ARS번호+1번(회원가입 및 정보수정)