SCOPUS
SCIE
Parapedobacter lycopersici sp. nov., isolated from the rhizosphere soil of tomato plants (Solanum lycopersicum L.)
저자
Kim, Jeong Myeong ; Lee, Shin Ae ; Cho, Hayoung ; Kim, Soo-Jin ; Joa, Jae-Ho ; Kwon, Soon-Wo ; Weon, Hang-Yeon
발행기관
학술지명
International journal of systematic and evolutionary microbiology
권호사항
발행연도
2017
작성언어
-등재정보
SCOPUS,SCIE
자료형태
학술저널
수록면
3728-3732(5쪽)
제공처
<P>A novel Gram-stain-negative bacterial strain, designated T16R-256(T), was isolated from the rhizosphere soil of tomato plants grown in a greenhouse in Yecheon-gun, Gyeongsangbuk-do, Republic of Korea and characterized using polyphasic taxonomy. Cells were aerobic, non-flagellated and rod-shaped. Colonies were light yellow, convex and round. The strain grew in the temperature range of 15-37 degrees C (optimally at 28-30 degrees C) and pH range of 7.0-9.0 (optimally at 7.0-8.0) and in 4% NaCl (w/v). A comparison of 16S rRNA gene sequences showed that strain T16R-256(T) is a member of the genus Parapedobacter, exhibiting high sequence similarity with Parapedobacter pyrenivorans P-4(T) (94.2 %), Parapedobacter indicus RK1(T) (93.7 %), Parapedobacter koreensis Jip14(T) (93.7 %), Parapedobacter luteus 4M29(T) (93.6 %) and Parapedobacter soli DCY14(T) (93.4 %). The major polar lipids were phosphatidylethanolamine, sphingolipid, one aminophospholipid, two aminolipids and three unknown lipids. The major fatty acids (> 10% of the total fatty acids) were iso-C-15 (:) (0), iso-C-17 (: 0) 3-OH and iso-C-15 (:) (0) 2-OH/C-16 : 1 omega 7c. Strain T16R-256(T) contained MK-7 as the predominant respiratory quinone and homospermidine as the major polyamine. The genomic DNA G+C content of the type strain was 55.5 mol%. On the basis of phenotypic, chemotaxonomic and phylogenetic data, strain T16R-256(T) should be designated as representative of a novel species of the genus Parapedobacter, for which the name Parapedobacter lycopersici sp. nov. is proposed. The type strain is T16R-256(T) (=KACC 18788(T) = JCM 31602(T)).</P>
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