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척수성 근위축증 환자의 유전형과 표현형에 대한 상관관계 연구 = Correlation between Genotype and Phenotype in Korean patients with Spinal Muscular Atrophy
저자
원선영(Seon-Young Won) ; 유경화(Kyong-Hwa Ryu) ; 이은하(Eun-Ha Lee) ; 한시훈(Si-Houn Hahn) ; 배기수(Ki-Soo Pai) ; 김성환(Sung-Hwan Kim)
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
1999
작성언어
-주제어
KDC
516
등재정보
KCI등재후보
자료형태
학술저널
수록면
10-20(11쪽)
제공처
배 경 : 척수성근위축증(SMA)은 척수 전각세포나 뇌간핵의 변성 또는 소실로 인해 점진적 인 근력의 약화나 근위축을 초래하는 질환으로 상염색체상에서 열성 유전되는 소아 신경근질환이다. 이 질환은 염색체 5번 장완(5q11.2-13.3)에 존재하는 여러 candidate gene, 즉 SMN, NAIP 및 p44 유전자의 결함으로 발생되는 것으로 본다. Candidate 유전자들의 분자적 특징이 증명되었음에도 불구하고, 유전양상과 임상양상과의 상관관계는 아직 불분명한 상태이다. 유전자의 결손과 같이 유전자 conversion도 중요한 기작으로 부각되고 있으며, 유전양상과 임상양상과의 상관관계에 대한 연구에는 많은 어려움들이 나타나고 있다.
목 적 : 한국인 척수성 근위축증 환자에서 SMN, NAIP 및 p44 유전자의 척수성 근위축증 표현형에 미치는 영향을 관찰하여 유전적인 양상과 표현형 사이의 상관관계를 규명하고, 유전자의 결손뿐만 아니라 유전자의 conversion이 질환 발현에 중요한 기전이 될 수 있음을 규명하고자 하였다. 또한 이 연구에서는 정상 신생아에서의 유전자의 rearrangement의 빈도를 조사하였다.
방 법 : 척수성 근위축증에 영향을 주는 candidate 유전자인 SMN 유전자의 exon 7과 exon 8, NAIP 유전자의 exon 5와 p44 유전자 5'말단의 C15l유전자의 결손을 확인하기 위해 각각의 primer을 이용하여 PCR 증폭을 하였으며, PCR 산물들을 각각 DraⅠ, DdeⅠ, Alu의 제한효소를 처리하여, 결손 여부를 관찰하였다. 또한, p44 유전자의 3'말단의 N1839부위는 SSCP로 분석하였다.
결 과 :
1) 제 1형 환자 8명과 제 2형 환자 2명에 대한 조사에서 제 1형 환자 5명에서 SMN 유전자 뿐만 아니라, NAIP와 p44 유전자의 결손을 관찰하였고 나머지 제 1형의 3명과 제 2형 모두에서는 SMN 유전자만이 결손 되어 있었다.
2) 본 연구 대상아 100명에서 SMN와 NAIP 유전자의 결손 여부를 관찰한 결과 NAIP 유전자는 모두 존재하였으나, centromeric SMN 유전자가 2%정도에서 결손 되어 있음을 확인하였다.
3) SMN, NAIP 및 p44 유전자 모두 결손을 보이는 제 1형 환자 중 telomeric exon 8만이 존재하는 환아 1명에서 telomeric exon 7이 centromeric exon 7로 유전자 conversion이 발생된 것을 확인하였다.
결론 : 척수성 근위축증 중 제 1형에서만 candidate 유전자인 SMN, NAIP 및 p44 유전자의 결손이 발견되어 이 세 가지 유전자 모두의 결손이 임상적으로 심한 양상과 관련이 높은 것으로 추정되나 SMN 유전자만 결손된 경우도 제 1형과 제 2형 모두에서 발견되어 SMN 유전자결손 외에 또 다른 요소가 임상양상에 영향을 주는 것으로 추정된다. 한 명의 제 1형
환자에서 관찰된 centromeric SMN 유전자의 telomeric 위치로의 gene conversion은 SMN 유전자 copy수와 임상양상간의 상관관계가 불분명함을 제시하고 있다. 정상아에서 관찰된 높은 빈도의 유전자 rearrangement는 산전진단시 주의를 필요로 하는 것으로 생각된다.
Background : Spinal muscular atrophy(SMA) is the second most common disease with autosomal recessive mode of inheritance in children and characterized by degeneration of anterior horn cells of the spinal cord resulting in weakness and wasting of voluntary muscles. This disease is caused by deletion of many candidate genes including SMN, p44, NAIP on chromosome 5q11.2-13.3. Although molecular characteristics of candidate genes were identified, genotype-phenotype correlation has not been clearly elucidated yet. Nevertheless, gene conversion, previously described as simply as gene deletion, appears to be very important mechanism as a molecular pathogenesis, and even makes more difficult to pursue the correlation.
Purpose : This study was aimed to define the correlation between genotype and phenotype of SMA in Korean patients. The significance of SMN gene as well as NAIP gene, p44 gene in the progress of disease process and phenotypic correlation with gene conversion was evaluated. This study was also undertaken to determine the frequency of gene rearrangements in normal population.
Method : Eight type Ⅰ SMA patients and two type Ⅱ SMA patients were studied. SMN, NAIP, and p44 gene deletion were analysed by PCR amplification and restriction enzyme digestion with DraⅠ, DdeⅠ and AluⅠ, respectively. p44 gene was also analyzed by SSCP. Gene conversion was defined by centromeric and telomeric SMN gene exon 7 to exon 8 PCR amplification followed by DdeⅠ restiction enzyme digestion.
Result :
1) Five of eight type Ⅰ patients showed deletion of SMN, NAIP and p44 gene, while the rest of type Ⅰ and all type Ⅱ patients showed deletion of SMN gene only.
2) We examined SMN and NAIP gene deletion on 100 normal newborns, which showed the deletion of centromeric SMN gene in two newborns, the relative frequency of 2% in gene rearrangement.
3) There was one case of type Ⅰ SMA showing deletion of telomeric SMN exon 7 but not SMN axon 8 suggestive of gene conversion occurred during the recombination as a molecular pathogenesis.
Conclusion : The major deletion of SMA candidate genes, SMN, NAIP, and p44 gene appear to be involved in severe phenotype since these three candidate genes deletion were noted only in type 1 cases. However, SMN gene deletion only identified both in type 1 and type 2 explains that SMN gene may plan an major role in the pathogenesis of SMA and also suggests that other factors may be affecting the severity in spinal muscular atrophy. One patient with type Ⅰ which showed the conversion of the centromeric SMN gene to the teleomeric gene strongly supports that SMN gene copy number may not be correlated with the severity in SMA. Our molecular findings suggest that phenotype is not clearly correlated with genotype. Prenatal screening should be carefully undertaken to interpretate because of high frequency of gene rearrangements in normal populations.
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