KCI등재
SCOPUS
SCIE
Identification of QTLs associated with the anaerobic germination potential using a set of Oryza nivara introgression lines
저자
Licheng Liu (Hunan Agricultural University) ; Xiaoxiang Li (Hunan Academy of Agricultural Science) ; Sanxiong Liu (Hunan Academy of Agricultural Science) ; Jun Min (Hunan Academy of Agricultural Science) ; Wenqiang Liu (Hunan Academy of Agricultural Science) ; Xiaowu Pan (Hunan Academy of Agricultural Science) ; Baohua Fang (Hunan Academy of Agricultural Science) ; Min Hu (Hunan Academy of Agricultural Science) ; Zhongqi Liu (Hunan Agricultural University) ; Yongchao Li (Hunan Academy of Agricultural Science) ; Haiqing Zhang (Hunan Agricultural University)
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2021
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English
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KCI등재,SCOPUS,SCIE
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학술저널
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399-406(8쪽)
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Background Rice (Oryza sativa L.) is an important crop and a staple food for half of the population around the world. The recent water and labor shortages are encouraging farmers to shift from traditional transplanting to direct-seeding. However, poor germination and slow elongation of the coleoptile constrains large-scale application of direct-seeding.
Objective Thisstudy was aimed to investigate the genetic basis of the anaerobic germination(AG) potential using a set of Oryza nivara (O. nivara) introgressionlines (ILs).
Methods Inthis study, a total of 131 ILs were developed by introducing O. nivara chromosomesegments into the elite indica rice variety 93-11 through advanced backcrossingand repeated selfng. A high-density genetic map has been previouslyconstructed with 1,070 bin-markers. The seeds of ILs were germinated and usedto measure coleoptile length under normal and anaerobic conditions. QTLsassociated with AG potential were determined in rice.
Results Basedon the high-density genetic map of the IL population, two QTLs, qAGP1 and qAGP3 associated with AG tolerance were characterized and locatedon chromosomes 1 and 3, respectively. Each QTL explained 15% of the phenotypic variance.Specifcally, the O. nivara-derived chromosomesegments of the two QTLs were positively tolerance to anaerobic condition byincreasing coleoptile length. In a further analysis of public transcriptomedata, a total of 26 and 36 genes within qAGP1 and qAGP3 were transcriptionallyinduced by anaerobic stress, respectively.
Conclusions Utilizationof O. nivara-derived alleles at qAGP1 and qAGP3 can potentially enhance tolerance to anaerobic stress at thegermination stage in rice, thereby accelerating breeding of rice varieties tobe more adaptative for direct-seeding.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2015-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2012-05-07 | 학술지명변경 | 한글명 : 한국유전학회지 -> Genes & Genomics | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-04-14 | 학술지명변경 | 외국어명 : Korean Journal of Genetics -> Genes and Genomics | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2003-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2002-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
1999-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.51 | 0.12 | 0.38 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.32 | 0.27 | 0.258 | 0.02 |
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