KCI등재
SCOPUS
SCIE
Circular RNA expression profile of systemic lupus erythematosus and its clinical significance as a potential novel biomarker
저자
Li Wenyu (the First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, China) ; Fan Runge (the First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, China) ; Zhou Cheng (the First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, China) ; Wei Yue (the First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, China) ; Lin Shunsheng (the First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, China) ; Wen Sijian (the First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, China) ; Zeng Wen (the First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, China) ; Hou Wei (Chinese Academy of Medical Sciences, China) ; Zhao Cheng (the First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, China) ; Lin Youkun (the First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University, China)
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2022
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재,SCOPUS,SCIE
자료형태
학술저널
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1405-1414(10쪽)
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Background: Circular RNAs (circRNAs) are a class of endogenous noncoding RNAs that are more abundant, specific, and highly organized than linear RNAs. Increasing evidence supports that circRNAs may serve as diagnostic biomarkers in many diseases, but their potential as biomarkers in systemic lupus erythematosus (SLE) remains unclear.
Objective: We investigated the critical circRNAs involved in SLE progression and explored their potential application as biomarkers in SLE.
Method: RNA sequencing was conducted on peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from 4 SLE patients and 4 healthy volunteers. CircRNA profile data were analyzed to identify differentially expressed circRNAs and visualized via R software. After screening, qPCR analysis of target circRNA expression was performed using PBMCs from 31 SLE patients and 35 healthy volunteers. Correlations between circRNA expression levels and the SLEDAI score were assessed via Spearman correlation analysis. Finally, the performance of circRNAs as biomarkers in SLE was examined by receiver operating characteristic curve analysis.
Results: The result identified six differentially expressed circRNAs between SLE patients and healthy controls: hsa_circ_0006689, hsa_circ_0070562, hsa_circ_0006117, hsa_circ_0007683, hsa_circ_0042519, and hsa_circ_0008647. The validation analysis showed differing relative expression levels of hsa_circ_0007683, hsa_circ_0042519, hsa_circ_0008647, and hsa_circ_0006689 between SLE patients and healthy volunteers (P < 0.05), and hsa_circ_0006689 expression in PBMCs correlated with the SLEDAI score (P < 0.05). Furthermore, addition of hsa_circ_0006689 expression increased the sensitivities of anti-dsDNA antibody and anti-Sm antibody levels for SLE diagnosis (from 29.03 to 61.30% and 32.26-71.00%, respectively).
Conclusion: Our results suggest hsa_circ_0006689 may be a useful circRNA biomarker for SLE diagnosis and prognosis.
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