KCI등재
SCIE
SCOPUS
Identification and characterization of novel single nucleotide polymorphism markers for fat deposition in muscle tissue of pigs using amplified fragment length polymorphism
저자
Pantaporn Supakankul (Chiang Mai University, Thailand) ; Tanavadee Kumchoo (Chiang Mai University, Thailand) ; Supamit Mekchay (Chiang Mai University, Thailand) 연구자관계분석
발행기관
학술지명
Animal Bioscience (ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES)
권호사항
발행연도
2017
작성언어
English
주제어
KDC
527
등재정보
KCI등재,SCIE,SCOPUS
자료형태
학술저널
수록면
338-346(9쪽)
KCI 피인용횟수
1
DOI식별코드
제공처
Objective: This study was conducted to identify and evaluate the effective single nucleotide polymorphism (SNP) markers for fat deposition in the longissimus dorsi muscles of pigs using the amplified fragment length polymorphism (AFLP) approach.
Methods: Sixty-four selective primer combinations were used to identify the AFLP markers in the 20 highest- and 20 lowest-intramuscular fat (IMF) content phenotypes. Five AFLP fragments were converted into simple codominant SNP markers. These SNP markers were tested in terms of their association with IMF content and fatty acid (FA) composition traits in 620 commercially crossbred pigs.
Results: The SSC7 g.4937240C>G marker showed an association with IMF content (p<0.05). The SSC9 g.5496647_5496662insdel marker showed a significant association with IMF content and arachidonic levels (p<0.05). The SSC10 g.71225134G>A marker revealed an association with palmitoleic and ω9 FA levels (p<0.05), while the SSC17 g.61976696G>T marker showed a significant association with IMF content and FA levels of palmitoleic, eicosenoic, arachidonic, monounsaturated fatty acids, and ω9 FA levels. However, no significant association of SSC8 g.47338181G>A was observed with any IMF and FA levels in this study.
Conclusion: Four SNP markers (SSC7 g.4937240C>G, SSC9 g.5496647_5496662insdel, SSC10 g.71225134G>A, and SSC17 g.61976696G>T) were found to be associated with IMF and/or FA content traits in commercially crossbred pigs. These findings provide evidence of the novel SNP markers as being potentially useful for selecting pigs with the desirable IMF content and FA composition.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2021-01-01 | 학술지명변경 | 한글명 : ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES -> Animal Bioscience외국어명 : ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES -> Animal Bioscience | KCI등재 |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2013-10-01 | 평가 | SCI 등재 (등재유지) | KCI등재 |
2013-10-01 | 평가 | SCOPUS 등재 (등재유지) | KCI등재 |
2012-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (기타) | KCI후보 |
2011-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2009-12-29 | 학회명변경 | 한글명 : 아세아ㆍ태평양축산학회 -> 아세아·태평양축산학회 | KCI후보 |
2005-09-28 | 학술지명변경 | 한글명 : 아세아태평양축산학회지 -> ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES | KCI후보 |
2003-01-01 | 평가 | SCIE 등재 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 1.03 | 0.23 | 0.76 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.6 | 0.5 | 0.367 | 0.04 |
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