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Analytical and Clinical Validation of Six Commercial Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus RNA Detection Kits Based on Real-Time Reverse-Transcription PCR
Background: During the 2015 outbreak of Middle East Respiratory Syndrome coronavirus (MERS-CoV), six different commercial MERS-CoV RNA detection kits based on real-time reverse-transcription polymerase chain reaction (rRT-PCR) were available in Korea. We performed analytical and clinical validations of these kits.
Methods: PowerChek (Kogene Biotech, Korea), DiaPlexQ (SolGent, Korea), Anyplex (Seegene, Korea), AccuPower (Bioneer, Korea), LightMix (Roche Molecular Diagnostics, Switzerland), and UltraFast kits (Nanobiosys, Korea) were evaluated. Limits of detection (LOD) with 95% probability values were estimated by testing 16 replicates of upstream of the envelope gene (upE) and open reading frame 1a (ORF1a) RNA transcripts. Specificity was estimated by using 28 nasopharyngeal swabs that were positive for other respiratory viruses. Clinical sensitivity was evaluated by using 18 lower respiratory specimens. The sensitivity test panel and the high inhibition panel were composed of nine specimens each, including eight and six specimens that were positive for MERS-CoV, respectively.
Results: The LODs for upE ranged from 21.88 to 263.03 copies/reaction, and those for ORF1a ranged from 6.92 to 128.82 copies/reaction. No cross-reactivity with other respiratory viruses was found. All six kits correctly identified 8 of 8 (100%) positive clinical specimens. Based on results from the high inhibition panel, PowerChek and AccuPower were the least sensitive to the presence of PCR inhibition.
Conclusions: The overall sensitivity and specificity of all six assay systems were sufficient for diagnosing MERS-CoV infection. However, the analytical sensitivity and detection ability in specimens with PCR inhibition could be improved with the use of appropriate internal controls.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2012-05-21 | 학술지명변경 | 한글명 : The Korean Journal of Laboratory Medicine -> Annals of Laboratory Medicine외국어명 : The Korean Journal of Laboratory Medicine -> Annals of Laboratory Medicine | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 학술지 분리 (기타) | KCI등재 |
2010-06-29 | 학술지명변경 | 한글명 : 대한진단검사의학회지 -> The Korean Journal of Laboratory Medicine | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2005-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2002-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
1999-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 1.51 | 0.18 | 1.15 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.91 | 0.81 | 0.458 | 0.08 |
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