KCI등재
SCIE
SCOPUS
Transcriptome response of the Pacific oyster, Crassostrea gigas susceptible to thermal stress: A comparison with the response of tolerant oyster
저자
Bo-Mi Kim (Unit of Polar Genomics, Korea Polar Research Institute, Incheon 21990, Republic of Korea) ; Kyobum Kim (Division of Bioengineering, College of Life Sciences and Bioengineering, Incheon National Universit) ; Ik-Young Choi (Department of Agriculture and Life Industry, Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic) ; Jae-Sung Rhee (Department of Marine Science, College of Natural Sciences, Incheon National University, Incheon 220) ; J.-S. Rhee (Incheon National University, Incheon 22012, Republic of Korea) ; I.-Y. Choi (Kangwon National University, Chuncheon 24341, Republic of Korea) 연구자관계분석
발행기관
학술지명
Molecular & cellular toxicology(Molecular & Cellular Toxicology)
권호사항
발행연도
2017
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재,SCIE,SCOPUS
자료형태
학술저널
수록면
105-113(9쪽)
KCI 피인용횟수
17
제공처
A lthough oysters are exposed to seasonal temperature changes, they are frequently subjected to acute temperature stress during emersion due to their attachment on their rocky shore habitats. To understand the effect of acute temperature elevation on the whole transcriptome of susceptible Pacific oyster Crassostrea gigas over time, the oysters were exposed to temperatures ranging from the control 20°C to 32°C for 72 h. We compared the genome-wide patterns of mRNA expression of susceptible oysters with those obtained from thermotolerant oysters. RNA-seq identified differentially expressed stress responsive Gene Ontology (GO) terms and relevant transcripts following acute thermal stress. The clearest pattern between susceptible and tolerant oysters was the dramatic differences in transcriptional expression in the hsp70 gene family. GO terms and genes typically associated with oxygen binding were also repressed compared to those of tolerant oysters. This study provides insights into the significant differences in molecular response of susceptible C. gigas to acute heat stress, and the will further our understanding of the basis of molecular adaptation in the Pacific oyster.
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2016 | 0 | 0 | 0 |
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