KCI등재
SCIE
SCOPUS
Inverse PCR for subtyping of Acinetobacter baumannii carrying ISAba1
저자
Shukho Kim (Kyungpook National University) ; Yun-Ju Park (Kyungpook National University) ; Jungmin Kim (Kyungpook National University) 연구자관계분석
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2016
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재,SCIE,SCOPUS
자료형태
학술저널
수록면
376-380(5쪽)
KCI 피인용횟수
3
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Acinetobacter baumannii has been prevalent in nosocomial infections, often causing outbreaks in intensive care units.
ISAba1 is an insertion sequence that has been identified only in A. baumannii and its copy number varies among strains.
It has been reported that ISAba1 provides a promoter for blaOXA-51-like, blaOXA-23-like, and blaampC, which are associated with the resistance of A. baumannii to carbapenems and cephalosporins.
The main purpose of this study was to develop a novel inverse PCR method capable of typing A. baumannii strains. The method involves three major steps: cutting of genomic DNA with a restriction enzyme, ligation, and PCR.
In the first step, bacterial genomic DNA was digested with DpnI. In the second step, the digested genomic DNAs were ligated to form intramolecular circular DNAs. In the last step, the ligated circular DNAs were amplified by PCR with primers specific for ISAba1 and the amplified PCR products were electrophoresed. Twenty-two clinical isolates of A. baumannii were used for the evaluation of the inverse PCR (iPCR) typing method. Dendrogram analysis revealed two major clusters, similar to pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) results.
Three ISAba1-associated genes – blaampC, blaOXA-66-like, and csuD – were amplified and detected in the clinical isolates.
This novel iPCR typing method is comparable to PFGE in its ability to discriminate A. baumannii strains, and is a promising molecular epidemiological tool for investigating A.
baumannii carrying ISAba1.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2013-12-02 | 학술지명변경 | 외국어명 : The Journal of Microbiology -> Journal of Microbiology | KCI등재 |
2010-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2006-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2001-07-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
1999-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 1.76 | 0.2 | 1.22 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.91 | 0.73 | 0.399 | 0.07 |
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