KCI등재
SCIE
SCOPUS
Analysis of phylogenetic markers for classification of a hydrogen peroxide producing Streptococcus oralis isolated from saliva by a newly devised differential medium
저자
Pham Ha (Daegu Catholic University School of Medicine) ; Tran Thi Dieu Thuy (Daegu Catholic University School of Medicine) ; Yang Youri (Gwangju Institute of Science and Technology) ; Ahn Jae-Hyung (Rural Development Administration) ; Hur Hor-Gil (Gwangju Institute of Science and Technology) ; 김용학 (대구가톨릭대학교)
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2022
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English
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KCI등재,SCIE,SCOPUS
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학술저널
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795-805(11쪽)
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Hydrogen peroxide (H2O2) is produced by alpha-hemolytic streptococci in aerobic conditions. However, the suitable method for detection of H2O2-producing streptococci in oral microbiota has not been setup. Here we show that o-dianisidine dye and horseradish peroxidase were useful in tryptic soy agar medium to detect and isolate H2O2-producing bacteria with the detection limit of one target colony in > 106 colony-forming units. As a proof, we isolated the strain HP01 (KCTC 21190) from a saliva sample using the medium and analyzed its characteristics. Further tests showed that the strain HP01 belongs to Streptococcus oralis in the Mitis group and characteristically forms short-chain streptococcal cells with a high capacity of acid tolerance and biofilm formation. The genome analysis revealed divergence of the strain HP01 from the type strains of S. oralis. They showed distinctive phylogenetic distances in their ROS-scavenging proteins, including superoxide dismutase SodA, thioredoxin TrxA, thioredoxin reductase TrxB, thioredoxin-like protein YtpP, and glutaredoxin- like protein NrdH, as well as a large number of antimicrobial resistance genes and horizontally transferred genes.
The concatenated ROS-scavenging protein sequence can be used to identify and evaluate Streptococcus species and subspecies based on phylogenetic analysis.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2013-12-02 | 학술지명변경 | 외국어명 : The Journal of Microbiology -> Journal of Microbiology | KCI등재 |
2010-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2006-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2001-07-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
1999-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 1.76 | 0.2 | 1.22 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.91 | 0.73 | 0.399 | 0.07 |
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