SCOPUS
SCIE
Clostridium arbusti sp. nov., an anaerobic bacterium isolated from pear orchard soil
저자
Jung, Min Young ; Park, In-Soon ; Kim, Wonyong ; Kim, Hong Lim ; Paek, Woon Kee ; Chang, Young-Hyo
발행기관
학술지명
International journal of systematic and evolutionary microbiology
권호사항
발행연도
2010
작성언어
-등재정보
SCOPUS,SCIE
자료형태
학술저널
수록면
2231-2235(5쪽)
제공처
<P>An obligately anaerobic, Gram-positive, spore-forming bacterial strain, designated SL206<SUP>T</SUP>, was isolated from pear orchard soils. Strain SL206<SUP>T</SUP> cells were straight or slightly curved rods, with motility by peritrichate flagella. Cell walls contained <I>meso</I>-diaminopimelic acid; wall sugars were glucose, rhamnose and mannose. The major fatty acids were C16 : 0, C18 : 1<I>ω</I>9<I>c</I> and summed feature 10 (containing C18 : 1<I>ω</I>11<I>c</I>/9<I>t</I>/6<I>t</I>). API 20A reactions were negative for oxidase, catalase and acid production from l-rhamnose, sucrose, trehalose, d-xylose, melezitose, salicin and d-sorbitol, and positive for acid production from d-glucose, sucrose, maltose, d-mannose and raffinose. Glucose was fermented to acetate, butyrate, CO2, H2 and ethanol in culture. The G<I>+</I>C content of the genomic DNA was 31.1 mol%. Based on comparative 16S rRNA gene sequence analysis, the isolate belonged to the genus <I>Clostridium</I> and formed a clade with <I>Clostridium pasteurianum</I>. The species most closely related to strain SL206<SUP>T</SUP> were <I>C. pasteurianum</I> (98.6 % similarity) and <I>Clostridium acidisoli</I> (97.8 % similarity). In DNA-DNA relatedness studies, the isolate had 59.5 % relatedness with <I>C. pasteurianum</I> and thus represented a unique species. On the basis of these studies, strain SL206<SUP>T</SUP> (=KCTC 5449<SUP>T</SUP> =JCM 14858<SUP>T</SUP>) is proposed to represent the type strain of a novel species, <I>Clostridium arbusti</I> sp. nov.</P>
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