KCI등재
SCIE
SCOPUS
Genome-wide Analysis of Iron-Regulated Transporter 1 (IRT1) Genes in Plants
저자
Recep Vatansever (Marmara University) ; Ertugrul Filiz (Duzce University) ; Ibrahim Ilker Ozyigit (Marmara University)
발행기관
학술지명
Horticulture, Environment, and Biotechnology(Horticulture, Environment, and Biotechnology)
권호사항
발행연도
2015
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재,SCIE,SCOPUS
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
516-523(8쪽)
KCI 피인용횟수
6
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제공처
Iron (Fe) is an essential micronutrient required in a number of biological processes in plant species. Fe transporters are a type of broad-range metal transporter and have different families functioning in different compartments. This study focused on iron-regulated transporter 1 (IRT1), which are mainly responsible for Fe uptake from root, in 17 selected plant species with an emphasis on Brachypodium distachyon, Chlamydomonas reinhardtii, Solanum lycopersicum and Populus trichocarpa species. All IRT1 proteins were observed to belong to the ZIP (PF02535) protein family with eight transmembrane (TM) domains, and have a similar molecular weight (33.86-42.72 kDa, except for C. reinhardtii with 65.83 kDa) and amino acid length (324-408 aa, except for C. reinhardtii with 639 aa), with pI values of 5.31-7.16. The sub-cellular localization of these proteins was predicted to be the plasma membrane. Similar exon numbers were also detected with most genes having 2-3, except for C. reinhardtii (5), Physcomitrella patens (5) and Vitis vinifera (4). In a phylogenetic tree, monocot-dicot separation was not observed in main groups but some subgroups included only monocot or dicot proteins. Predicted interaction partner analysis of AtIRT1 (AT2G30080.1) pointed to main interaction partners either directly related with iron transport or that of other metal ion. The results of this study provide a theoretical reference for elucidating the structural and biological role of IRT1 genes/proteins in plant species.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2010-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2006-04-07 | 학술지명변경 | 한글명 : -> Horticulture, Environment, and Biotechnology | KCI등재 |
2006-02-28 | 학술지명변경 | 한글명 : 한국원예학회지 -> 외국어명 : Journal of the Korean Horticultural Scie -> Horticulture, Environment, and Biotechnology | KCI등재 |
2006-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2001-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
1998-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.89 | 0.35 | 0.69 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.59 | 0.5 | 0.638 | 0.05 |
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