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생물정보학을 이용한 연체동물의 NLS (Nuclear Localization Signals) 포함 단백질의 분석Bioinformatic Analysis of NLS (Nuclear Localization Signals)-containing Proteins from Mollusks = Bioinformatic Analysis of NLS (Nuclear Localization Signals)-containing Proteins from Mollusks
localization of a protein containing nuclear localization signals (NLS) has been well studied in many organisms ranging from invertebrates to vertebrates. However, no systematic analysis of NLS-containing proteins available from Mollusks has been reported. Here, we describe in silico screening of NLS-containing proteins using the mollusks database that contains 22,138 amino acids. To screen putative proteins with NLS-motif, we used both predict NLS and perl script. As a result, we have found 266 proteins containing NLS sequences which are about 1.2% out of the entire proteins. On the basis of KOG (The eukaryotic orthologous groups) analysis, we can't predict the precise functions of the NLS-containing proteins. However, we found out that these proteins belong to several types of proteins such as chromatin structure and dynamics, translation, ribosomal structure, biogenesis, and signal transduction mechanism. In addition, we have analysed these sequences based on the classes of mollusks. We could not find many from the species that are the main subjects of phylogenetic studies. In contrast, we noticed that cephalopods has the highest number of NLS-containing proteins. Thus, we have constructed mollusks NLS database and added these information and data to the mollusks database by constructing web interface. Taken together, these information will be very useful for those who are or will be studying NLS-containing proteins from mollusks.
더보기연체동물 유래 아미노산 서열 22,138 개에서 NLS가 예측되는 아미노산 서열은 266 개였으며 이는 연체동물 전체 아미노산 중 1.2% 정도였다. 또한 현재 등재되어 있는 연체동물 8,314 종 중 NLS를 포함한 아미노산이 밝혀진 생물은 60여 종에 불과 하였다. 현재 알려진 연체동물 서열 중에는 두족 강의 경우가 NLS를 포함한 아미노산이 많을 것으로 예측되었다. ACKNOWLEDGEMENT이 연구과제는 1999년도 인제대학교 학술연구조성연구사업의 일환으로 수행되었습니다.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2026 | 평가예정 | 재인증평가 신청대상 (재인증) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (재인증) | KCI등재 |
2017-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (계속평가) | KCI등재 |
2013-01-01 | 평가 | 등재 1차 FAIL (등재유지) | KCI등재 |
2010-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2008-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
2007-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
2006-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보2차) | KCI후보 |
2005-05-30 | 학술지명변경 | 한글명 : 한국패류학회지 -> The Korean Journal of Malacology | KCI후보 |
2005-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2004-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
2003-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.33 | 0.33 | 0.34 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.35 | 0.34 | 0.331 | 0.1 |
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