KCI등재
SCI
SCIE
SCOPUS
Evaluation of In-Hospital Cluster of COVID-19 Associated With a Patient With Prolonged Viral Shedding Using Whole-Genome Sequencing
저자
Jung Jiwon (Department of Infectious Diseases, Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine, Seoul, Korea.Office for Infection Control, Asan Medical Center, Seoul, Korea.) ; Lee Jungmin (Department of Microbiology, Institute for Viral Diseases, Vaccine Innovation Center, College of Medicine, Korea University, Seoul, Korea.) ; Kim Sun-Kyung (Office for Infection Control, Asan Medical Center, Seoul, Korea.) ; Park Soyeon (Office for Infection Control, Asan Medical Center, Seoul, Korea.) ; Lim Young-Ju (Office for Infection Control, Asan Medical Center, Seoul, Korea.) ; Kim Eun Ok (Office for Infection Control, Asan Medical Center, Seoul, Korea.) ; Park Heedo (Department of Microbiology, Institute for Viral Diseases, Vaccine Innovation Center, College of Medicine, Korea University, Seoul, Korea.) ; Park Man-Seong (Department of Microbiology, Institute for Viral Diseases, Vaccine Innovation Center, College of Medicine, Korea University, Seoul, Korea.) ; Kim Sung-Han (Department of Infectious Diseases, Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine, Seoul, Korea.Office for Infection Control, Asan Medical Center, Seoul, Korea.)
발행기관
학술지명
Journal of Korean medical science(Journal of Korean Medical Science)
권호사항
발행연도
2022
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재,SCI,SCIE,SCOPUS
자료형태
학술저널
수록면
1-6(6쪽)
DOI식별코드
제공처
Background: Patients with hematologic malignancies may produce replication-competent virus beyond 20 days of SARS-CoV-2 infection. However, data regarding the transmission of SARS-CoV-2 from patients with prolonged viral shedding is limited.
Methods: In May 2022, four additional cases of COVID-19 were reported in a hematologic ward at a tertiary care hospital in South Korea, after an 8-week isolation of a patient with prolonged viral shedding. We performed whole-genome sequencing (WGS) of SARS-CoV-2 to evaluate the possibility of post-isolation transmission from this prolonged viral shedding.
Results: A patient (case 1) with acute myeloid leukemia was released from isolation 54 days after the diagnosis of COVID-19 based on rising Ct value of up to 29.3, and moved to a sixpatient room. On days 10 and 11 post-isolation, his doctor (case 2) and 2 patients who were his roommates (case 3, 4) had positive SARS-CoV-2 PCR results. Additionally, 16 days postisolation, another patient (case 5) in a remote room had positive SARS-CoV-2 PCR result. All the three patients were hospitalized for ≥ 14 days when they were diagnosed with SARS-CoV-2 infection. Except for case 3, the remaining 4 cases were available for WGS, which revealed that case 1 exhibited a 7 nucleotides difference in comparison to cases 4 and 5 and case 2 displayed a 20 nucleotides difference compared with case 1, while sequences of cases 4 and 5 were identical.
Conclusions: Despite the possibility of transmission from the patient with prolonged viral shedding, no evidence of the transmission of SARS-CoV-2 from the patient with prolonged positive RT-PCR using WGS was found.
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