SCIE
SCOPUS
KCI등재
Development of a One-Step Duplex RT-PCR Method for the Simultaneous Detection of VP3/VP1 and VP1/P2B Regions of the Hepatitis A Virus = Development of a One-Step Duplex RT-PCR Method for the Simultaneous Detection of VP3/VP1 and VP1/P2B Regions of the Hepatitis A Virus
저자
( Mi-ju Kim ) ; ( Shin-young Lee ) (Kyung Hee University) ; ( Hyun-joong Kim ) ; ( Jeong Su Lee ) (National Institute of Food and Drug Safety Evaluation) ; ( In Sun Joo ) (National Institute of Food and Drug Safety Evaluation) ; ( Hyo Sun Kwak ) (National Institute of Food and Drug Safety Evaluation) ; ( Hae-yeong Kim ) 연구자관계분석
발행기관
학술지명
Journal of microbiology and biotechnology(Journal of Microbiology and Biotechnology)
권호사항
발행연도
2016
작성언어
Korean
주제어
등재정보
SCIE,SCOPUS,KCI등재
자료형태
학술저널
수록면
1398-1403(6쪽)
DOI식별코드
제공처
소장기관
The simultaneous detection and accurate identification of hepatitis A virus (HAV) is critical in food safety and epidemiological studies to prevent the spread of HAV outbreaks. Towards this goal, a one-step duplex reverse-transcription (RT)-PCR method was developed targeting the VP1/P2B and VP3/VP1 regions of the HAV genome for the qualitative detection of HAV. An HAV RT-qPCR standard curve was produced for the quantification of HAV RNA. The detection limit of the duplex RT-PCR method was 2.8 × 101 copies of HAV. The PCR products enabled HAV genotyping analysis through DNA sequencing, which can be applied for epidemiological investigations. The ability of this duplex RT-PCR method to detect HAV was evaluated with HAV-spiked samples of fresh lettuce, frozen strawberries, and oysters. The limit of detection of the one-step duplex RT-PCR for each food model was 9.4 × 102 copies/20 g fresh lettuce, 9.7 × 103 copies/20 g frozen strawberries, and 4.1 × 103 copies/1.5 g oysters. Use of a one-step duplex RT-PCR method has advantages such as shorter time, decreased cost, and decreased labor owing to the single amplification reaction instead of four amplifications necessary for nested RT-PCR.
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