KCI등재
SCIE
SCOPUS
The length of guide RNA and target DNA heteroduplex effects on CRISPR/Cas9 mediated genome editing efficiency in porcine cells
저자
Jiawei Lv (Northeast Agricultural University) ; Shuang Wu (Northeast Agricultural University) ; Renyue Wei (Northeast Agricultural University) ; Yan Li (Northeast Agricultural University) ; Junxue Jin (Northeast Agricultural University) ; Yanshuang Mu (Northeast Agricultural University) ; Yu Zhang (Northeast Agricultural University) ; Qingran Kong (Northeast Agricultural University) ; Xiaogang Weng (Northeast Agricultural University) ; Zhonghua Liu (Northeast Agricultural University)
발행기관
학술지명
Journal of Veterinary Science(Journal of Veterinary Science)
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발행연도
2019
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English
주제어
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KCI등재,SCIE,SCOPUS
자료형태
학술저널
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1-9(9쪽)
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1
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The clustered regularly interspaced short palindrome repeats (CRISPR)/CRISPR-associated protein 9 (Cas9) system is a versatile genome editing tool with high efficiency. A guide sequence of 20 nucleotides (nt) is commonly used in application of CRISPR/Cas9; however, the relationship between the length of the guide sequence and the efficiency of CRISPR/ Cas9 in porcine cells is still not clear. To illustrate this issue, guide RNAs of different lengths targeting the EGFP gene were designed. Specifically, guide RNAs of 17 nt or longer were sufficient to direct the Cas9 protein to cleave target DNA sequences, while 15 nt or shorter guide RNAs had loss-of-function. Full-length guide RNAs complemented with mismatches also showed loss-of-function. When the shortened guide RNA and target DNA heteroduplex (gRNA:DNA heteroduplex) was blocked by mismatch, the CRISPR/Cas9 would be interfered with. These results suggested the length of the gRNA:DNA heteroduplex was a key factor for maintaining high efficiency of the CRISPR/Cas9 system rather than weak bonding between shortened guide RNA and Cas9 in porcine cells.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2006-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2005-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2003-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 1.08 | 0.11 | 0.76 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.61 | 0.51 | 0.245 | 0.05 |
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