Mannanase를 생산하는 Bacillus속 균의 RAPD-PCR 분석 = Comparison of RAPD-PCR Products between Strains of Bacillus Producing Mannanase
저자
윤기홍 (우송대학교 식품생명영양학부)
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2004
작성언어
Korean
주제어
KDC
051.000
자료형태
학술저널
수록면
257-270(14쪽)
제공처
가정에서 제조된 된장에서 mannanase 생산성이 높은 균으로 분리된 9종의 균주는 모두 포자를 형성하며 그람양성 간균으로 Bacillus속에 속하는 것으로 추정된다. 이들 분리균간에 유전체의 유사성을 조사하기 위해 10 nucleotides로 구성된 oligonucleotides 6 종과 12 nucleotides로 구성된 oligonucleotides 2종을 primer로 사용하여 Random Amplified Polymorphic DNA-중합연쇄반응 (RAPD-PCR)의 조건을 검토한 결과 40℃보다는 30℃와 35℃에서 annealing 반응을 수행하는 것이 효율적이었다. RAPD-PCR에 의해 증폭된 DNA를 agarsoe gel 전기영동으로 분석한 결과 primer에 따라 증폭된 DNA의 양과 그 크기의 다양성이 달랐으며, 분리균에 따라서도 특이한 증폭 DNA가 관찰되었다. 균주에 따라 증폭된 DNA를 비교한 결과 된장에서 분리된 9 종의 균주는 Bacillus licheniformis와는 달랐으며, Bacillus subtilis와 유사하였다. 특히 분리균 중 5 종류는 B. subtilis와 유사도가 매우 높았으며, 분리균간에도 서로 유사도가 높은 균이 있었지만 동일하지는 않은 것으로 확인되었다. 따라서 RAPD-PCR 방법에 의해 균주간 유사성을 비교하는 것은 다양한 미생물 자원을 확보하는데 유용한 방법이라고 여겨진다.
Nine bacterial strains producing the extracellular mannanase were isolated from Korean soybean paste. The isolates are regarded as Bacillus on the basis of their morphological properties, which are gram positive and rod in shape with spore. To examine the similarity between genomes of the isolates, Random Amplified Polymorphic DNA - Polymerase Chain Reaction (RAPD-PCR) was performed with 6 kinds of oligonucleotides consisting of 10 nucleotides and 2 kinds of oligonucleotides consisting of 12 nucleotides. As a results of RAPD-PCR at different annealing temperatures such as 30℃, 35℃ and 40℃, many different DNA fragments were generated at 30℃ and 35℃ more than 40℃. Relatedness of the nine isolates from soybean was determined by comparing the amplified DNA fragments between the isolate strains, Bacillus subtilis and B. licheniformis, expecting that the nine isolates are different from B. licheniformis and five of them are very similar to B. subtilis. It was also found that all isolates are different strains. Therefore, RAPD-PCR is regarded as a useful method for preparing the bank of the diverse microorganisms from nature.
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