KCI등재
The Multifunctional Protein, Snd1, Involved in tRNA Splicing of the Fission Yeast
저자
발행기관
학술지명
한국엔터테인먼트산업학회논문지(Journal of Korea Entertainment Industry Association)
권호사항
발행연도
2016
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재
자료형태
학술저널
수록면
439-449(11쪽)
제공처
본 연구실에서는 이전의 연구에서 6개의 tRNA splicing mutant를 S. pombe의 ts mutant bank로 부터분리하였다. 본 연구에서는 이중의 하나 ptp 4<SUP>-</SUP>mutant에 해당하는 wild type의 유전자 (ptp4- 2<SUP>+</SUP> )를 genomic DNA library로부터 growth defect의 complementation에 의해 cloning하였다. ptp4- 2<SUP>+</SUP> 유전자는 ptp 4<SUP>-</SUP> mutant의 growth defect와 tRNA splicing defect를 complementation하였다. 이 유전자의 서열을 분석한 결과 NCBI의 database에 등록된 Snd1 유전자의 서열과 일치하였다. Snd1은 세포의 여러 과정에 관련된 multifuctional protein으로 알려져 있고 이 단백질은 4개의 SN domain과 하나의 Tudor domain으로 구성되어 있다. 이의 유전자 서열과 ptp4- 2<SUP>+</SUP> 유전자의 서열을 비교 분석한 결과 본 연구의 ptp4- 2<SUP>+</SUP> 는 Snd1 단백질의 4개의 SN domain 중 3개를 포함하고 있음을 알 수 있었다. 이 결과로 미루어 S. pombe의 tRNA splicing에는 Snd1 단백질의 SN domain이 관련되는 것으로 사료된다. Snd1은 암세포에서 과발현되고 carcinogenesis에 관여하는 단백질로써 알려져 있어 tumor marker의 좋은 후보자이다. 암세포에서 tRNA 또한 과발현되는 점을 고려하면 본 연구는 암세포에서 tRNA와 Snd1의 연관관계뿐만 아니라 나아가 carcinogenesis의 기작을 이해하는데 기여할 수 있을 것으로 사료된다.
더보기By screening a bank of temperature sensitive mutants of Schizosaccharomyces pombe, we had previously isolated six pre-tRNA splicing mutants named ptp1 to ptp6. We cloned the ptp4-2<SUP>+</SUP> gene from a genomic DNA library by complementation of the growth defect. The recovered plasmid contains a 2.4 kb insert and complements the growth defect of the ptp4<SUP>-</SUP> mutant by 87%. The 2.0 kb subclone of this plasmid showed 60% complementation of the growth defect. Introduction of the ptp4-2<SUP>+</SUP>genes into the ptp4<SUP>-</SUP> mutant cells restores the ability to splice tRNA. The nucleotide sequence of the ptp4-2+ gene was identical to the part of sequence of S. pombe chromosome III in the database of National Center for Biotechnology Information. There was only one truncated open reading frame in entire 2.4 kb sequence. The full-length open reading frame encodes Snd1, the multifunctional protein involved in various cellular processes. The 2.4 kb or 2.0 kb yeast DNA of the ptp4-2<SUP>+</SUP> subclone contains only staphylococcal nuclease (SN) domains of the Snd1, suggesting that the SN domains of the Snd1 protein may participate in tRNA splicing. Snd1 is known to be involved in carcinogenesis and over-expressed in cancer cells. Considering that all tRNA expression is increased in cancer cells, the results in here may shed light in understanding the connection between tRNA and Snd1 in tumor cells as well as the mechanisms of carcinogenesis by Snd1.
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